生物信息学期刊
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生物信息学

China Journal of Bioinformatics

CSTPCD

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本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物,报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位:
哈尔滨工业大学
ISSN:
1672-5565
CN:
23-1513/Q
出版周期:
季刊
邮编:
150001
地址:
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
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  • 作者: 吴永英 朱昌雄 李丽华 王立群 田云龙 蒋细良
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年1期
    页码:  1-4
    摘要: 利用PCR技术,首次从淡紫灰链霉菌海南变种(Streptomyces lavendulae var.hainanensis)的基因组克隆出了中生菌素生物合成基因簇中的负责β-赖氨酸活化的zp...
  • 作者: 屠康 李霞 王栋 郭政 颜兴起
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年1期
    页码:  5-7
    摘要: Gene Ontology广泛地应用于基于基因芯片数据的差异表达功能类分析.基因芯片技术存在检测缺失与检测误差等问题.本文探讨上述这二个因素对利用基因表达谱挖掘Gene Ontology中差...
  • 作者: 张旭东 李霞 王亚东 苏小红
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年1期
    页码:  8-12
    摘要: 由于基因表达数据高属性维、低样本维的特点,Fisher分类器对该种数据分类性能不是很高.本文提出了Fisher的改进算法Fisher-List.该算法独特之处在于为每个类别确定一个决策阀值,...
  • 作者: 张光亚 方柏山
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年1期
    页码:  13-15,18
    摘要: 利用x2分析方法,对6种古菌起始密码子上游和终止密码子下游各50位非编码区进行了分析.结果表明,Methanopyris kandleri和Aeropyrum pernix中存在一个与大肠杆...
  • 作者: 何伟宁 张琳 朱志伟 李汝莘 赵毅彬
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年1期
    页码:  16-18
    摘要: 采用基于Web三层结构的系统结构,利用PHP技术与MySQL网络数据库的结合实现了基于Web的高校实验中心网站的设计与开发,并介绍了网站的基本内容及强大功能.
  • 作者: 曾涛 李晚霞 莫忠息
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年1期
    页码:  19-21,37
    摘要: 对预测蛋白质空间结构的拟物算法的有效性进行理论分析,证明用该拟物算法求得合法的结构存在较大的随机性;给出折叠结构发生冲突的判断条件和提高拟物算法有效性的一些修正方案.
  • 作者: 李岩松 杨谦
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年1期
    页码:  22-25
    摘要: 用基因本体论(Gene Ontology,GO)中的相关的规范术语和BLAST分析结果来对球毛壳菌EST及CONTIG序列信息进行注释,利用GO的语义模型构建不同物种数据库之间的语义联接,在...
  • 作者: 陆克中 须文波
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年1期
    页码:  26-29
    摘要: 介绍了蛋白质二级结构预测的研究意义,讨论了用在蛋白质二级结构预测方面的神经网络设计问题,并且较详尽地评述了近些年来用神经网络方法在蛋白质二级结构预测中的主要工作进展情况,展望了蛋白质结构预测...
  • 作者: 徐慧 李燕峰 欧阳芳平 郭爱敏 马松山
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年1期
    页码:  30-33
    摘要: 评述了近年来对DNA的电子传递特性的研究进展,并介绍了关于DNA电子传递机制及理论的研究结果.同时,结合从无序体系的角度研究DNA内电子传递特性的工作,对围绕DNA内电子传递问题的争论要点以...
  • 作者: 印莉萍 肖海华 许雪峰 韩振海
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年1期
    页码:  34-37
    摘要: 扼要介绍了酵母双杂交技术的原理,详细评述了该技术在植物功能基因组中的研究进展,并结合自己研究领域对该技术在植物领域发展方向作了展望.
  • 作者: 孟凡立 张卫国 陈庆山
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年1期
    页码:  38-40,48
    摘要: 插入突变库的构建是功能基因组学研究的一个重要内容,可为确定基因的功能提供最直接的证据.构建插入突变库的方法有T-DNA插入突变、转座子插入突变和质粒介导的插入突变.本文分别介绍三种方法的原理...
  • 作者: 徐继伟
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年1期
    页码:  41-44
    摘要: 从信息处理的角度来看,生物信息学与自然语言处理中的许多问题是非常相似的,因此,可以将一些自然语言处理中的经典方法应用到生物信息学文字中.本文介绍了自然语言处理和生物信息学中共有的问题,如比对...
  • 作者: 喻宏 张智清
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年1期
    页码:  45-48
    摘要: 二磷酸腺苷核糖多聚酶[Poly(ADP-Ribose)Polymerase,PARP]是一类具有重要生理功能的蛋白酶.PARP能催化二磷酸腺苷核糖多聚化反应.二磷酸腺苷核糖多聚化对DNA修复...
  • 作者: 伍宁丰 初晓宇 姚斌 田健 范云六 邓敏捷
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年2期
    页码:  49-52
    摘要: 将氨基酸的多序列局部比对、基于结构的序列比对和氨基酸替换忍耐性分析等方法联合起来对甲基对硫磷水解酶OPHC2进行了序列分析,确定出4组保守性功能序列.根据其高级结构发现这类酶具有典型的α/β...
  • 作者: 王景林 贾杨 阮承迈
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年2期
    页码:  53-56,61
    摘要: 比较GenBank中4个不同毒株的A型肉毒神经毒素(BoNT/A)的基因组序列,发现其基因序列的一致性高达92.2%~99.9%.基于保守性高的BoNT/A氨基酸序列,根据BioSun和La...
  • 作者: 冯友军 姜明国 张会敏
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年2期
    页码:  57-61
    摘要: 利用电子克隆技术从稻瘟菌中克隆到一个新的Ⅰ型烯醇化酶全长cDNA,暂命为MgEno-1.MgEno-1全长1571核苷酸,其预测的ORF为1317核苷酸,共编码438个氨基酸.起始密码子AT...
  • 作者: 孙谧 王跃军 袁翠 郝建华
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年2期
    页码:  62-64
    摘要: 对一株来自黄海的假单胞杆菌QD80所产的碱性蛋白酶QDAPr进行了生物信息学分析,并用生物信息学软件对其空间结构进行了模拟,同时对模建结果进行了结构质量的分析和检测.最后对模建的结果进行了初...
  • 作者: 敖伟 杜耀华 王正志
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年2期
    页码:  65-68,84
    摘要: 主要对从一段DNA序列中提取出信息以判别其中是否含有启动子的问题进行了研究.首先从固定长度的序列中提取成分特征和结构特征,然后将这些特征输入到一个非线性分类器中进行判别.测试结果显示,在正集...
  • 作者: 艾华水 黄路生
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年2期
    页码:  69-71,91
    摘要: 用Perl语言编写了一个脚本--FS2M01.pl来实现片段大小表向0/1矩阵的转换,解决了由人工方法将遗传图谱的位点信息转换成0/1矩阵的问题.
  • 作者: 王晓敏 王正志
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年2期
    页码:  72-75
    摘要: 重复序列分析在全基因组研究中起着重要作用,其首要任务就是在DNA序列中识别并定位所有的重复结构.本文提出了一种新的算法,此算法基于一种简单的数据结构--后缀数,用于查找给定的DNA序列中所有...
  • 作者: 张云 杨宏伟
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年2期
    页码:  76-78,84
    摘要: 利用数学形态学知识和图像处理方法,对缺铁性贫血的血液显微图像进行了分析,编制了相应的计算程序,对选取的区域内细胞的个数、半径和面积等重要参数进行了统计和处理,这对进一步研究细胞及其组织变化、...
  • 作者: 孙振球 方平 胡德华 虢毅 黄碧云
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年2期
    页码:  79-80
    摘要: 生物信息检索和荻取成为当前非常重要而紧迫的研究课题,我们采用元搜索引擎技术、JAVA和HTML编程语言研制开发了基于WWW生物信息集成检索系统,该系统提供了统一的检索界面,对15分子生物学数...
  • 作者: 姜焱
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年2期
    页码:  81-84
    摘要: 毕赤酵母表达系统是一种新的真核基因表达系统,由于其有许多突出的优点,如它既有原核生物的特点,又有真核生物的特性,可以对目的蛋白质进行糖基化、二硫键形成等翻译后修饰等特点,越来越受到分子生物学...
  • 作者: 吴永英 王广旭 王立群
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年2期
    页码:  85-87,94
    摘要: 微卫星标记技术一出现,就以其独特的优点引起了动物遗传育种学家的广泛关注,显示出较好的应用前景.本文就微卫星标记的特点及其在动物遗传育种中的应用作以综述.
  • 作者: 袁凤辉 邓昶 陈连水 饶军
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年2期
    页码:  88-91
    摘要: 生物体的信息代谢是指依托生物体物质和能量代谢、建立在生物体各组织结构层次上的由单源信息的出现到互信息的构建到组合信息的形成到信息网络的整合以及由信息网络到组合信息到互信息到单源信息的逐渐崩解...
  • 作者: 吴永英 吴韶平 张晓东 彭科峰 曹立群 王立群
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年2期
    页码:  92-94
    摘要: 通过介绍环境生物技术及生物信息学的产生发展及应用,概述了环境生物技术信息学的内容与应用前景.
  • 作者: 吴永英 易华西 王专
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年2期
    页码:  95-封三
    摘要: 酪蛋白是生物活性肽的重要来源,可以通过体内的胃肠消化和食品加工过程中的酶解将其释放出来.乳酪蛋白源的生物活性肽的生物学意义、对人类健康的影响和其在新型功能性食品加工中的作用具有重要的研究价值...
  • 作者: 刘盛纲 竺笑 赵胜 钟金城 陈智华
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年3期
    页码:  98-101
    摘要: 利用一系列的生物信息学软件分析了牦牛HSP72蛋白的氨基酸组成、等电点、亚细胞定位、跨膜区、疏水/亲水区、结构域、特征位点、二级结构等蛋白质性质,并同普通牛、猪和人的蛋白作了对比.结果表明:...
  • 作者: 夏启容 张燎原 方柏山 曹阳 洪燕
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年3期
    页码:  102-104,127
    摘要: 用Swiss-Model和Modeller对来源于Klebsiella pneumonide的1,3-丙二醇氧化还原酶(PDOR)进行三级结构建模,并对所得的6个目标模型进行评价和比较,从中...
  • 作者: 朱明珠 李霞 郭政 高磊
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2006年3期
    页码:  105-108
    摘要: 利用基因表达谱数据,通过计算互作蛋白质的表达相关系数,来筛选、优化蛋白质互作网络.结果显示,利用经过筛选的互作数据,根据邻居计数法和卡方法进行功能预测的预测效果明显提高,距离待测蛋白质较远的...

生物信息学基本信息

刊名 生物信息学 主编 任南琪
曾用名
主办单位 哈尔滨工业大学  主管单位 中华人民共和国工业和信息化部
出版周期 季刊 语种
chi
ISSN 1672-5565 CN 23-1513/Q
邮编 150001 电子邮箱 itgene@sohu.com
电话 0451-86414135;0451-86417711(吴永英) 网址 http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx
地址 黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼

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