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摘要:
重复序列分析在全基因组研究中起着重要作用,其首要任务就是在DNA序列中识别并定位所有的重复结构.本文提出了一种新的算法,此算法基于一种简单的数据结构--后缀数,用于查找给定的DNA序列中所有的最大串联重复.并且在该算法的基础上编写了一个有效实用的软件--RepLocate,同时给出了它应用到已知的DNA序列的实例.
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文献信息
篇名 基于后缀列的基因序列最大串联重复查找技术
来源期刊 生物信息学 学科 工学
关键词 最大串联重复 后缀阵 基因组序列
年,卷(期) 2006,(2) 所属期刊栏目 技术与方法
研究方向 页码范围 72-75
页数 4页 分类号 TP311
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1672-5565.2006.02.007
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王正志 国防科技大学自动控制系 85 629 13.0 20.0
2 王晓敏 国防科技大学自动控制系 1 8 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
最大串联重复
后缀阵
基因组序列
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物信息学
季刊
1672-5565
23-1513/Q
大16开
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
14-14
2003
chi
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