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生物信息学
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China Journal of Bioinformatics
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本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物，报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位：
哈尔滨工业大学
ISSN：
1672-5565
CN：
23-1513/Q
出版周期：
季刊
邮编：
150001
地址：
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 用生物信息分析方法对已在GenBank上注册的拟南芥等13种植物金属硫蛋白MT2的氨基酸序列与组成、亚细胞定位、跨膜区与信号肽、疏水性/亲水性、蛋白质二、三级结构以及功能等进行分析与预测.结...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 为分析LRP16基因启动子区顺式调控元件,为深入研究LRP16基因的表达调控机制奠定基础.首先在NCBI的人类基因组数据库中截取并下载LRP16基因转录起始位点5'侧翼区2.6kb的基因组序...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 对柔嫩艾美尔球虫EST-SSR进行生物信息学分析,共获取Eimeria tenella EST序列34 074条,总长度为16.45Mb,小于12bp SSR的ESTs达7 651条,从中获...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 应用生物信息学的方法对GenBank中拟南芥、火炬松、胡麻、紫花罗兰等植物香豆酸-3-羟基化酶(c3h)基因以及本实验室克隆的欧美杨107的c3h基因(AM920690)核苷酸序列以及翻译的...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 利用文献计量学方法,统计分析了1995-2007年11月Web ofScience收录的生物信息学(bioinformatics)究文献,探讨了生物信息学文献研究的年代分布、语种、期刊分布、...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 为了整合文献中大量的人类蛋白质与疾病相互关系的信息,通过文本挖掘和通路分析的方法从PubMed中的摘要提取出对应关系后,利用KEGG中的通路信息构建出人类蛋白质和疾病相互的一个网络效应,并构...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 利用857条植物miRNA序列对27546条小立碗藓mRNA序列进行搜索,预测出162个植物miRNA家族在小立碗藓中存在结合靶位.miRNA结合靶位数目和miRNA协同作用网络分析结果同时...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 基于差错控制原理,将遗传信息中由海量碱基构成的DNA序列看作经过编码而获得的具有某种编码特性的编码序列.在此基础上,将编码理论中分组码的分析方法用于对DNA序列进行分析,选用了(6,3) 分...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 采用组织块法分离培养牙周膜细胞和牙龈成纤维细胞,测定二者的增殖特性和ALP活性,利用免疫组化和FCM方法比较I、III型胶原、BMP的表达情况,以观察对比两种细胞的生物学特性的异同.找出牙龈...
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10. 大肠杆菌启动子特征参数的统计分析刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 首先统计了683条大肠杆菌sigma70启动子序列的每个位点单碱基频率,并计算了每个位点单碱基体现保守性的M1(l)值和相应涨落限,从而获得多个大于涨落限的保守位点.其次,对大肠杆菌的转录起...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 在分析基因数据时,往往有噪音出现,因此借用基因表达谱数据中的噪音来建立卡诺图,可以得到布尔网络逻辑函数.而且利用此方法确定蛋白质与蛋白质之间的逻辑关系,建立蛋白质的逻辑网络.通过该方法可以寻...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 系统发育谱方法是目前研究较多的一种基于非同源性的生物大分子功能注释方法.针对现有算法存在的一些缺陷,从两个方面对该方法做了改进:一是构造基于权重的系统发育谱;二是采用改进的聚类算法对发育谱的...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 基因表达谱的可视化本质上是高维数据的降维问题.采用流形学习算法来解决基因表达谱的降维数据可视化,讨论了典型的流形学习算法(Isomap和LLE)在表达谱降维中的适用性.通过类内/类间距离定量...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 基因调控网络模型为深入理解生命本质提供了一个新的研究框架和平台.作为基因调控网络模型的其中一种,互信息关联网络模型使用熵和互信息描述基因和基因之间的关联.本文描述了用互信息度量基因表达相似性...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 为了在体外无损地实现对血管壁动态信息、心电和心音信号等医学信息多参数的综合同步检测以及分析和处理,利用虚拟仪器技术设计了血管壁动态信息多参数的无创检测辅助诊断系统. 该系统硬件平台由信号输入...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 基于氨基酸的五字母模型,给出蛋白质序列的一种新的三维图形表示,然后构造一个12维向量来刻画蛋白质序列,这个向量的分量是与12个图形相对应的D/D矩阵的正规化的ALE-指标.最后基于S结构蛋白...
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17. 生物序列的聚类分析刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 通过不同的聚类方式,对公共数据库中生物序列数据进行生物信息的挖掘,以达到在更广泛和更深入的框架中了解它们之间的相互关系的目的.以帕金森病相关基因所对应的mRNA序列为例,使用双序列比对的得分...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 针对现有相关文献中离子通道电生理数据繁多且分散的特点,开发了一套电压门控离子通道电生理实验数据库.数据库中目前主要包括钠离子通道序列数据、调制剂分子结构和序列数据,并收集整理了文献中调制剂和...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 遗传算法是模拟生物进化过程的计算模型,是一种全局优化搜索算法.将遗传算法与转录因子结合位点识别问题相结合的新方法,以一致性序列模型作为保守motif的描述模型,通过对motif序列与待测序列...
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20. 时间序列的相似性测度刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 时间序列(time series) 是指按时间顺序排列的观测值集合,在生物信息学研究领域中,DNA序列和基因表达数据都可以视为时间序列数据.时间序列分析中很重要的环节就是刻划两个时间序列或者...
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21. 系统发育谱构建方法研究刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年1期页码:摘要： 随着后基因组时代的到来,系统发育谱方法作为一种非同源性的功能注释方法,已经被成功的应用到基因组功能预测、蛋白质相互作用预测等一些重要领域的研究中去.本文阐述了系统发育谱法的基本原理,详细地介...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年2期页码:摘要： 利用RT-PCR从欧美杨107次生木质部中克隆出一961bp 的CCR基因片段.通过生物信息学软件对该序列的核苷酸序列、拟翻译的氨基酸序列的疏水性、残基带电量及表面暴露区、蛋白质二级结构、亚...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年2期页码:摘要： 蛋白质质谱技术是蛋白质组学的重要研究工具,它被出色地应用于癌症早期诊断等领域,但是蛋白质质谱数据带来的维灾难问题使得降维成为质谱分析的必需的步骤.本文首先将美国国家癌症研究所提供的高分辨率S...
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24. 基于模糊理论预测CpG岛新方法刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年2期页码:摘要： 启动子区域的CpG岛的异常甲基化是识别癌症的重要标志之一.目前已经建立的一些CpG岛的预测思想和方法都有自身的缺点,基于模糊理论的预测思想从贴进度的角度来判定CpG岛,能更容易地找到被以往方...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年2期页码:摘要： k-均值聚类算法是一种广泛应用于基因表达数据聚类分析中的迭代变换算法,它通常用距离法来表示基因间的关系,但不能有效的反应基因间的相互依赖的关系.为此,提出基于信息论的k-modes聚类算法,...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年2期页码:摘要： 对急性髓性白血病(AML)病人进行明确的亚型分类,有助于制定合适的治疗方案并预测其治疗效果.之前研究表明基因芯片技术在白血病亚型分类中已取得了较好效果,但由于儿童AML发病率较低,相应的芯片...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年2期页码:摘要： 应用多相分散体系的动力稳定性和聚结稳定性理论,以薄膜分散法构建了靶向树突状细胞(dendritic cells,DCs)表面分子DEC-205长循环免疫脂质体(anti-DEC-205 iL...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年2期页码:摘要： 水溶性环氧化合物水解酶(Soluble Epoxide Hydrolase,SEH)是一组催化环氧化合物水解为相应邻位二醇的酶类,在哺乳动物、植物、昆虫和微生物体内广泛存在.通过BLAST对...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年2期页码:摘要： 植物miRNA的研究已经从小规模实验向大规模计算分析方向发展,生物信息学的应用成为当前植物miRNA研究的热点问题.本文回顾了最近几年生物信息学在植物miRNA研究中取得的最新进展,简要介绍...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2009年2期页码:摘要： 通过选取人类启动子与非启动子序列中不同的k-mer作为预测算法的基础特征,分别以三个区域(-249～-1;0～+50;-30～+30)的6-mer频数作为离散源参数构建离散增量,同时选取24...
生物信息学基本信息
| 刊名 | 生物信息学 | 主编 | 任南琪 |
| 曾用名 | |||
| 主办单位 | 哈尔滨工业大学 | 主管单位 | 中华人民共和国工业和信息化部 |
| 出版周期 | 季刊 | 语种 |
chi
|
| ISSN | 1672-5565 | CN | 23-1513/Q |
| 邮编 | 150001 | 电子邮箱 | itgene@sohu.com |
| 电话 | 0451-86414135；0451-86417711（吴永英） | 网址 | http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx |
| 地址 | 黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼 |
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