遗传算法在转录因子结合位点识别中的应用

• 作者: 孙平平 崔颖 陆林英 马志强 马雅楠 魏雅卓
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 工学
• 关键词: 遗传算法(GA) 转录因子结合位点(TFBS) 一致性序列模型
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 页码范围: 72-74,77
• 页数: 4页
• 分类号: TP301
• 字数: 3854字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2009.01.019

摘要

遗传算法是模拟生物进化过程的计算模型,是一种全局优化搜索算法.将遗传算法与转录因子结合位点识别问题相结合的新方法,以一致性序列模型作为保守motif的描述模型,通过对motif序列与待测序列的比对问题进行编码,将其转化成搜索空间中的优化问题,利用遗传算法来搜索最优解,预测转录因子的结合位点.实验结果表明,这种新的方法是有效的,它在占用少量内存的情况下能够准确地识别出待测转录因子结合位点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马志强	东北师范大学计算机科学学院	40	337	10.0	16.0
2	孙平平	东北师范大学计算机科学学院	7	18	2.0	4.0
3	马雅楠	东北师范大学计算机科学学院	7	18	2.0	4.0
4	魏雅卓	东北师范大学计算机科学学院	7	23	3.0	4.0
5	陆林英	东北师范大学计算机科学学院	8	28	4.0	5.0
6	崔颖	东北师范大学计算机科学学院	8	17	2.0	4.0