生物信息学期刊
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生物信息学

China Journal of Bioinformatics

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本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物,报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位:
哈尔滨工业大学
ISSN:
1672-5565
CN:
23-1513/Q
出版周期:
季刊
邮编:
150001
地址:
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
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  • 作者: 冷嘉承 吴凌云
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年1期
    页码:  1-8
    摘要: RNA编辑是一个十分重要的生物细胞分子机制.作为转录后修饰的一步,它可以增加蛋白质组学多样性,改变转录产物的稳定性,调节基因表达等.RNA编辑失调会导致各种疾病,包括神经疾病和癌症.在动物中...
  • 作者: 宋德平 谌南辉
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年1期
    页码:  9-17
    摘要: 在前期生命信息安全控制原理探讨的基础上,基于整体论的思考,旨在构思能表述生命信息安全控制体系实质内涵的几何图形.所作图呈圆台形,自上而下依次为2大部分(内在部分和外延部分),5个层次(特异性...
  • 作者: 陈永孜
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年1期
    页码:  18-23
    摘要: 基因表达谱芯片和核酸序列数据在癌症研究中占有很重要的地位.基因表达谱芯片被广泛的应用在医学研究中,它的主要优势在于灵敏快速成本低,缺点只能对现有基因进行研究,无法进行新基因发现以及变异等方面...
  • 作者: 夏慧芳 江宏昊 郭雨珍
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年1期
    页码:  24-30
    摘要: 本文基于范德华力势能预测2D三向的蛋白质结构.首先,将蛋白质结构预测这一生物问题转化为数学问题,并建立基于范德华力势能函数的数学模型.其次,使用遗传算法对数学模型进行求解,为了提高蛋白质结构...
  • 作者: 何洪军 方略
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年1期
    页码:  31-38
    摘要: 生理学实验表明在鼠脑海马结构中存在的一种具有特异性放电特征的细胞,它在大鼠空间导航和环境认知中起着关键性作用,该特异性神经元被称之为位置细胞.本文将基于位置细胞、运动神经元来构建一种前馈神经...
  • 作者: 吴超 陈竞哲
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年1期
    页码:  39-44
    摘要: 关于酵母重组蛋白内的Bromodomain识别乙酰化赖氨酸的研究近年来受到广泛的关注,但是其识别配体并与之相紧密结合的机理有待进一步的研究.本文采用2015年开发的结合位点拓扑学方法(FCT...
  • 作者: 付伟 代芳 曹洁 王松 班春梅 谢东 邓亚婕
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年1期
    页码:  45-52
    摘要: 为探讨幽门螺杆菌感染胃组织后差异基因变化,深入分析参与疾病发生、发展的分子机制.从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载幽门螺杆菌感染胃组织基因芯片数据(GSE5...
  • 作者: 刘毅慧 朱树平
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年1期
    页码:  53-60
    摘要: 蛋白质二级结构的预测,对于研究蛋白质的功能和人类生命科学意义非凡.1951年开始提出预测蛋白质二级结构,1983年对于二级结构的预测只有50%的准确率.经过多年的发展,预测方式不断的改进和完...
  • 作者: 凌家梅 杨蕊萍 胡林 胡迎春 陈雪
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年1期
    页码:  61-66
    摘要: 为探究脓毒症休克与SIRS的差异表达基因及网络的构建,筛选潜在的核心基因,从GEO数据库下载相关基因表达谱GSE26378,数据分为脓毒症休克与SIRS各29个样本,通过在线软件GCBI对其...
  • 作者: 刘国庆
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年2期
    页码:  67-75
    摘要: 真核细胞中,作为染色质基本结构单元的核小体参与调控基因的转录、DNA复制、重组以及RNA剪接等诸多生物学过程.阐明核小体定位机制并准确预测核小体在染色体上的位置对解读染色质结构与功能有重要生...
  • 作者: 史延茂 董超 马萱
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年2期
    页码:  76-85
    摘要: 血栓病的干预方式包括抗血小板凝集、抗凝血和溶栓,对应临床应用的分别是抗血小板、抗凝血酶和纤溶酶溶栓药物;纤溶酶是主要的溶栓类药物,主要用于血栓发病后的治疗.纤溶酶种类多来自于生物体,更多来自...
  • 作者: 卢香香 张涛 李滚 杨鑫荣
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年2期
    页码:  86-94
    摘要: 乙肝病毒S蛋白是病毒的包膜蛋白,与病毒进入细胞有关,它存在逆转录过程并且具有极强的潜伏性.本论文应用生物信息学分析乙肝病毒S蛋白的序列特征,利用在线分析软件预测乙肝病毒S蛋白的理化性质和亲疏...
  • 作者: 丰继华 于华峥 刘珂 牟锦 郭亚茹 黄月月
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年2期
    页码:  95-101
    摘要: 在DNA序列上,定位模糊的特殊核小体与定位良好的普通核小体同时存在于染色体区域内,但由于二者的化学性质差异不明显,区分较为困难.本文针对实验核小体在真核基因转录起始位点周围的分布规律和保守性...
  • 作者: 孙毅勇 黄浩
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年2期
    页码:  102-110
    摘要: 为了进一步探究房颤患者心内不同位置信号的主导频率(Dominant frequency,简称DF)的关联性,本文对传统的Bot-teron's算法进行了改进.当信号中含有较大幅值的室波时,该...
  • 作者: 孙学溥 董雪松 邹小龙
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年2期
    页码:  111-115
    摘要: 为了探究增强子介导的核内miRNA在结肠癌发生中的作用,本研究筛选了结肠癌中的差异表达的miRNA数据、结肠的特异性增强子数据、结肠癌中差异表达基因数据,利用细胞核内miRNA靶向增强子预测...
  • 作者: 任启智 刘玉文 白晶 苏怡 苑洪菲
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年2期
    页码:  116-121
    摘要: 为了解黑龙江省细菌性腹泻病原谱构成,探讨主要病原体的变异和流行变迁规律,提高监测实验室腹泻病原实验室诊断、监测预警、突发细菌性腹泻疫情的处置能力,并为进一步防治工作提供科学依据.收集哨点医院...
  • 作者: 吕喜英 吴练练 曲杰 李青山 林萍萍
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年2期
    页码:  122-130
    摘要: NOP56是一种与癌基因表达密切相关的核仁蛋白.本文通过对在线数据进行差异表达基因分析,发现NOP56在乳腺癌组织中高表达.再以NOP56的表达高低为表型,分析不同表型与临床预后的差异,结果...
  • 作者: 罗静初
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年3期
    页码:  131-144
    摘要: UniProt(https://www.uniprot.org/)是国际知名蛋白质数据库,主要包括UniProtKB知识库、UniParc归档库和UniRef参考序列集三部分.UniProt...
  • 作者: 周娟 曾冰洁 李新梅 杨飘 赵小英 阎晋东
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年3期
    页码:  145-150
    摘要: 植物通过各类受体来感知外界环境的改变从而调节自身的生长和发育情况.在拟南芥中,植物主要通过隐花色素(Cryptochromes)和向光素(Phototropins)感知蓝光.同时ZEITLU...
  • 作者: 刘浩 张水寒 王勇庆 蔡媛 金剑 钟灿
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年3期
    页码:  151-160
    摘要: 长链非编码RNA(Long non-coding RNAs,lncRNAs)是一类广泛存在于真核生物中,长度大于200个核苷酸、无蛋白编码功能,具有调控基因转录后表达的RNA转录本.新近研究...
  • 作者: 冯永红 杨光红 王洁 秦莲花 雷依丽 高霄 黄劲
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年3期
    页码:  161-166
    摘要: 结核分枝杆菌生长缓慢,难以获得足量的天然蛋白抗原.而利用基因工程技术制备重组蛋白抗原,存在着表达量低、不易纯化,以及特异性较低等不利因素.随着生物信息技术的发展,研究者可根据生物信息学软件预...
  • 作者: 李佳慧 李惠敏 李璐璐 陈玉梅
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年3期
    页码:  167-174
    摘要: 几丁质酶是一类在植物抵抗病原真菌等过程中具有重要作用的蛋白质,为探讨几丁质酶在罗汉果抗根结线虫病中的调控作用,本研究基于南方根结线虫侵染下的罗汉果幼苗根系的转录组测序结果,采用生物信息学技术...
  • 作者: 李雷 蒋林华
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年3期
    页码:  175-181
    摘要: 近20年来,斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模型动物.同时,通过对斑马鱼参考基因组序列和10000多个蛋白编码基因的鉴定,表明斑马鱼至少与人类基因有75%的同源性,进一步验证了斑马鱼基因...
  • 作者: 丰继华 牟锦 郭亚茹
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年3期
    页码:  182-188
    摘要: 通过染色体交互频率数据(Hi-c)来预测染色体三维空间结构是近年表观遗传研究热点.研究表明染色体三维空间结构在生物基因表达、调控等方面起到重要作用,对其进行三维重构是研究细胞代谢过程的基本途...
  • 作者: 曾怀才 陈聪 陈鸿儒
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年3期
    页码:  189-194
    摘要: 利用生物信息学对miR-10a-5p的靶基因进行预测及相关分析,为miR-10a-5p靶基因的实验验证及其调控机制提供理论基础.通过miRBase获取并分析人、大鼠,小鼠等物种的miR-10...
  • 作者: 冯平 周岐海 肖航
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年4期
    页码:  195-206
    摘要: 长寿是一个复杂的特征,因遗传、环境等因素的差异而不同,理想情况下主要取决于衰老速率.相关分子机制多种多样,主要有生长激素(GH)和胰岛素样生长因子1(IGF-1)途径、Forkhead bo...
  • 作者: 唐旭清 戚家铭 王耀来
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年4期
    页码:  207-213
    摘要: 随着单分子检测技术水平的提高,学术界发现了与传统认知大相径庭的转录现象——转录爆发.基因转录不是连续平稳且波动较小的过程,而是表现出发生时间极不规律、信使RNA产量波动极大的特征.转录爆发本...
  • 作者: 张志国 王东
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年4期
    页码:  214-226
    摘要: 异柠檬酸脱氢酶(IDH)是三羧酸循环中的关键酶.为了进一步探索IDH的结构与功能,利用生物信息学方法对牛NAD(+)IDH进行分析.结果表明,该蛋白为亲水性蛋白,呈碱性,无跨膜区,在β亚基N...
  • 作者: 伊梦杰 唐慧 张锦锦 郭强
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年4期
    页码:  227-236
    摘要: 结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)是一种全球高发的恶性肿瘤,发病原因复杂且预后较差.近年来发现叉头框Q1(Forkhead box Q1,FOXQ1)基因作为一类核转录因...
  • 作者: 丰继华 刘珂 牟锦 郭亚茹 黄月月
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2019年4期
    页码:  237-248
    摘要: 核小体是染色体折叠的整体结构,它们的空间分布与基因组活动的调节密切相关,是基因工程和表观遗传的重要研究领域.为进一步研究核小体定位特征的物种间差异性,将希尔伯特-黄变换(HHT)引入到酵母和...

生物信息学基本信息

刊名 生物信息学 主编 任南琪
曾用名
主办单位 哈尔滨工业大学  主管单位 中华人民共和国工业和信息化部
出版周期 季刊 语种
chi
ISSN 1672-5565 CN 23-1513/Q
邮编 150001 电子邮箱 itgene@sohu.com
电话 0451-86414135;0451-86417711(吴永英) 网址 http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx
地址 黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼

生物信息学评价信息

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