基于Hi-c数据的酵母染色体三维结构重构

• 作者: 丰继华 牟锦 郭亚茹
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 农学
• 关键词: Hi-c数据 三维结构 梯度上升算法
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 182-188
• 页数: 7页
• 分类号: S963.32+7
• 字数: 2654字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12113/j.issn.1672-5565.201812007

摘要

通过染色体交互频率数据(Hi-c)来预测染色体三维空间结构是近年表观遗传研究热点.研究表明染色体三维空间结构在生物基因表达、调控等方面起到重要作用,对其进行三维重构是研究细胞代谢过程的基本途径.针对酵母Hi-c数据在不同染色体所呈现出的统计特征,拟合出每条染色体交互频率数据分布的数学模型,然后利用梯度上升迭代算法预测并重构其三维结构,并给出模型评估指标.实验结果表明,模型具有较高可重复性和预测精确度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	丰继华	云南民族大学电气信息工程学院	20	18	2.0	4.0
2	郭亚茹	云南民族大学电气信息工程学院	7	1	1.0	1.0
3	牟锦	云南民族大学电气信息工程学院	7	1	1.0	1.0