小儿脓毒症休克相关基因的筛选及网络构建

• 作者: 凌家梅 杨蕊萍 胡林 胡迎春 陈雪
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 脓毒症休克 SIRS 生物信息学 基因信号网络 基因共表达网络
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 61-66
• 页数: 6页
• 分类号: Q343.1
• 字数: 2837字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12113/j.issn.1672-5565.201805002

摘要

为探究脓毒症休克与SIRS的差异表达基因及网络的构建,筛选潜在的核心基因,从GEO数据库下载相关基因表达谱GSE26378,数据分为脓毒症休克与SIRS各29个样本,通过在线软件GCBI对其进行标准化及差异基因筛选;对差异基因进行GO分析;基于KEGG进行功能通路分析以及基因信号网络分析;差异基因共表达网络分析.结果表明:两组中总共有1456个基因被识别为差异基因(P<0.05),与SIRS组相比,脓毒症休克组中有条859条下调基因,597条上调基因.GO功能富集分析显示差异基因主要参与了细胞周期、细胞免疫、细胞代谢.KEGG功能通路分析显示差异基因主要参与了MAPK信号通路、P53信号通路、wnt信号通路、细胞凋亡信号通路,细胞周期受体信号通路等.共表达分析发现基因CCNB1、NUSAP1、OIP5、SHCBP1、ZWINT、TOP2A、DLGAP5等位于网络中央部位,而基因信号网络分析发现基因PLCB1、PIK3CA、STAT3、CAMK2D、PRKCB、CREB1位于网络核心.基因芯片分析有助于发现脓毒症休克与SIRS患儿外周血单核细胞在转录组学上的改变,而生物信息学网络分析有助于发现潜在的靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨蕊萍	西南医科大学临床医学院	3	4	1.0	2.0
2	陈雪	西南医科大学临床医学院	4	1	1.0	1.0
3	胡迎春	西南医科大学附属医院急诊科	8	6	1.0	2.0
4	凌家梅	四川省雅安市芦山县人民医院妇产科	1	0	0.0	0.0
5	胡林	四川省雅安市芦山县人民医院儿科	3	0	0.0	0.0