牛NAD(+)异柠檬酸脱氢酶生物信息学分析

• 作者: 张志国 王东
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 生物信息学 NAD(+)IDH 结构预测 功能分析
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 214-226
• 页数: 13页
• 分类号: Q55
• 字数: 6120字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12113/j.issn.1672-5565.201904002

摘要

异柠檬酸脱氢酶(IDH)是三羧酸循环中的关键酶.为了进一步探索IDH的结构与功能,利用生物信息学方法对牛NAD(+)IDH进行分析.结果表明,该蛋白为亲水性蛋白,呈碱性,无跨膜区,在β亚基N端存在长度为16个氨基酸的信号肽,亚细胞定位在线粒体.二级结构预测结果显示该蛋白的三个亚基均以α螺旋为主,并且其上的螺旋和折叠均紧密有序排列,这有助于形成特定的结构域并发挥特定的生物学功能.对α和γ两个亚基采用同源建模法预测其三级结构模型,β亚基采用折叠识别法预测其三级结构模型,预测结果质量评估均较好.此外,分析了不同亚基的表面电荷分布,并预测了最可能的异柠檬酸和ADP的结合位点.通过生物信息学方法进行合理预测,为进一步研究IDH家族尤其是哺乳动物NAD(+)IDH提供了重要理论依据.