罗汉果几丁质酶基因家族的生物信息学分析

• 作者: 李佳慧 李惠敏 李璐璐 陈玉梅
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 农学
• 关键词: 罗汉果 转录组测序 几丁质酶基因家族 理化特性
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 167-174
• 页数: 8页
• 分类号: S435.79
• 字数: 4944字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12113/j.issn.1672-5565.201903006

摘要

几丁质酶是一类在植物抵抗病原真菌等过程中具有重要作用的蛋白质,为探讨几丁质酶在罗汉果抗根结线虫病中的调控作用,本研究基于南方根结线虫侵染下的罗汉果幼苗根系的转录组测序结果,采用生物信息学技术对筛选到的15个罗汉果几丁质酶基因进行分析.结果表明,15个罗汉果几丁质相关蛋白基因编码的氨基酸序列其N段均有一段信号肽,亚细胞定位在胞外;分子量从27 kDa到37 KDa不等;多数为酸性蛋白.基于氨基酸保守结构域和系统发育关系分析,15个罗汉果几丁质酶分属于GH18和GH19两大家族中的3个组别(I、III和IV)的成员,GH18家族成员三级结构预测具有典型的(α/β)8桶状结构,而GH19家族成员三级结构预测只有α螺旋结构域.这些分析结果可为今后深入研究罗汉果几丁质酶的生物学功能和调控机制提供一定的理论依据,为罗汉果抗根结线虫病育种提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李惠敏	广西师范大学生命科学学院	35	250	10.0	15.0
2	陈玉梅	广西师范大学生命科学学院	9	10	1.0	3.0
3	李璐璐	广西师范大学生命科学学院	9	3	1.0	1.0
4	李佳慧	广西师范大学生命科学学院	3	0	0.0	0.0