结肠癌中核内miRNA的激活调控作用研究

• 作者: 孙学溥 董雪松 邹小龙
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 结肠癌 miRNA-增强子-靶基因网络 核内miRNA
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 111-115
• 页数: 5页
• 分类号: Q522
• 字数: 2190字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12113/j.issn.1672-5565.201903009

摘要

为了探究增强子介导的核内miRNA在结肠癌发生中的作用,本研究筛选了结肠癌中的差异表达的miRNA数据、结肠的特异性增强子数据、结肠癌中差异表达基因数据,利用细胞核内miRNA靶向增强子预测算法,筛选miRNA调控的结肠特异性增强子;利用增强子靶基因预测数据,筛选核内miRNA调控的差异表达靶基因,并且构建核内miRNA-靶基因网络,并通过网络的分析和筛选获得结肠癌中关键的致病基因,同时对网络中的靶基因进行GO的功能注释.结果表明,我们所构建的核内miRNA-激活调控靶基因网络包含miRNA-靶基因关系对2121个,259个节点,其中包含34个下调基因、183个上调的基因,7个下调的miRNA,35个上调的miRNA.而后我们分析了网络进行的节点度的整体分布情况,发现网络中大部分的节点的度都是小于10的,仅有少量miRNA结合和部分的差异表达基因节点的度大于10.核内miRNA主要通过激活调控了一些应激反应相关的功能和,同时,抑制调控了细胞周期、细胞凋亡、细胞死亡巨噬细胞代谢等相关功能,通过激活和抑制相关功能诱发结肠癌的发生.从核内miRNA的激活调控角度研究结肠癌的发病机制,是对原有细胞浆中miRNA抑制调控机制的补充,也为结肠癌的系统研究提供了新的视野.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙学溥	哈尔滨医科大学附属第一医院普外科	5	11	2.0	3.0
2	董雪松	哈尔滨医科大学附属第一医院普外科	3	0	0.0	0.0
3	邹小龙	哈尔滨医科大学附属第一医院普外科	9	15	2.0	3.0