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摘要:
水溶性环氧化合物水解酶(Soluble Epoxide Hydrolase,SEH)是一组催化环氧化合物水解为相应邻位二醇的酶类,在哺乳动物、植物、昆虫和微生物体内广泛存在.通过BLAST对水稻基因组的蛋白质数据库进行搜索,获得10个水溶性环氧化物水解酶(Soluble Epoxide Hydrolase SEH)sEH蛋白的同源序列.经分析发现这些基因在水稻不同胁迫处理下各个部位都有所表达,而且不同成员之间的表达模式存在较大的差异.水稻sEH蛋白主要参与角质层形成,应激反应,以及病原防御等生理过程,特别在脱毒过程中扮演着重要的角色.对蛋白质多序列联配和三级结构预测结果表明:水溶性环氧化合物水解酶的核心结构域由3个催化残基Asp、His和Asp形成三位一体的催化活性构象.这类基因的表达受抗逆环境诱导,其功能与抗逆性有关,为基因工程抗逆育种提供了参考.
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文献信息
篇名 水稻水溶性环氧化合物水解酶的生物信息学分析
来源期刊 生物信息学 学科 农学
关键词 水溶性环氧化合物水解酶(EH) 生物信息学 水稻
年,卷(期) 2009,(2) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 108-112,139
页数 6页 分类号 Q556|S511
字数 3134字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1672-5565.2009.02.007
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 郑柳城 广东海洋大学农学院 2 19 2.0 2.0
2 朱宏波 广东海洋大学农学院 20 159 9.0 12.0
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研究主题发展历程
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水溶性环氧化合物水解酶(EH)
生物信息学
水稻
研究起点
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物信息学
季刊
1672-5565
23-1513/Q
大16开
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
14-14
2003
chi
出版文献量(篇)
937
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6
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4610
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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