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水稻水溶性环氧化合物水解酶的生物信息学分析
水稻水溶性环氧化合物水解酶的生物信息学分析
作者:
朱宏波
郑柳城
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
水溶性环氧化合物水解酶(EH)
生物信息学
水稻
摘要:
水溶性环氧化合物水解酶(Soluble Epoxide Hydrolase,SEH)是一组催化环氧化合物水解为相应邻位二醇的酶类,在哺乳动物、植物、昆虫和微生物体内广泛存在.通过BLAST对水稻基因组的蛋白质数据库进行搜索,获得10个水溶性环氧化物水解酶(Soluble Epoxide Hydrolase SEH)sEH蛋白的同源序列.经分析发现这些基因在水稻不同胁迫处理下各个部位都有所表达,而且不同成员之间的表达模式存在较大的差异.水稻sEH蛋白主要参与角质层形成,应激反应,以及病原防御等生理过程,特别在脱毒过程中扮演着重要的角色.对蛋白质多序列联配和三级结构预测结果表明:水溶性环氧化合物水解酶的核心结构域由3个催化残基Asp、His和Asp形成三位一体的催化活性构象.这类基因的表达受抗逆环境诱导,其功能与抗逆性有关,为基因工程抗逆育种提供了参考.
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文献信息
篇名
水稻水溶性环氧化合物水解酶的生物信息学分析
来源期刊
生物信息学
学科
农学
关键词
水溶性环氧化合物水解酶(EH)
生物信息学
水稻
年,卷(期)
2009,(2)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
108-112,139
页数
6页
分类号
Q556|S511
字数
3134字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1672-5565.2009.02.007
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
郑柳城
广东海洋大学农学院
2
19
2.0
2.0
2
朱宏波
广东海洋大学农学院
20
159
9.0
12.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
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共引文献
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研究主题发展历程
节点文献
水溶性环氧化合物水解酶(EH)
生物信息学
水稻
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物信息学
主办单位:
哈尔滨工业大学
出版周期:
季刊
ISSN:
1672-5565
CN:
23-1513/Q
开本:
大16开
出版地:
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
邮发代号:
14-14
创刊时间:
2003
语种:
chi
出版文献量(篇)
937
总下载数(次)
6
总被引数(次)
4610
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
期刊文献
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