基于模糊理论预测CpG岛新方法

• 作者: 崔颖 张岩 王芳 王金龙 苏建忠
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: CpG岛 模糊理论 隶属函数 截集
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 页码范围: 91-94
• 页数: 4页
• 分类号: Q756
• 字数: 4569字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2009.02.003

摘要

启动子区域的CpG岛的异常甲基化是识别癌症的重要标志之一.目前已经建立的一些CpG岛的预测思想和方法都有自身的缺点,基于模糊理论的预测思想从贴进度的角度来判定CpG岛,能更容易地找到被以往方法所忽略的具有更多生物学意义的CpG岛.本研究通过构建属于CpG岛集合的隶属函数,计算候选序列的隶属度,找出所有的可接受隶属程度的CpG岛.将该方法应用于UCSC数据库中的一段序列(hg18_chr1_31618510_31623510_-1000)进行预测,发现提高了预测的精确度.可见应用模糊理论预测CpG岛具有一定的可行性,利用选取不同的截集,可以得到更为精确的CpG岛.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔颖	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	21	47	4.0	4.0
2	张岩	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	51	157	6.0	9.0
3	王金龙	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	5	18	3.0	4.0
4	王芳	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	34	139	6.0	11.0
5	苏建忠	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	12	32	4.0	4.0