杨树木质素合成酶CCR基因的序列分析及蛋白结构预测

• 作者: 薛永常 赵文超
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: CCR 序列分析 蛋白结构预测
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 页码范围: 81-84
• 页数: 4页
• 分类号: Q785
• 字数: 3853字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2009.02.001

摘要

利用RT-PCR从欧美杨107次生木质部中克隆出一961bp 的CCR基因片段.通过生物信息学软件对该序列的核苷酸序列、拟翻译的氨基酸序列的疏水性、残基带电量及表面暴露区、蛋白质二级结构、亚细胞定位及三维结构等进行了初步分析预测.结果表明该CCR基因含一个编码301个氨基酸的完整开放阅读框,其成熟蛋白为亲水性的、主要存在于细胞膜,具有大多数植物CCR 蛋白普遍存在的KNWYCYGK 的保守性基序,其二级结构中共包含12个α螺旋,20个β折叠,11个卷曲,并构建了其三维结构图.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛永常	大连工业大学生物与食品工程学院	59	364	10.0	17.0
2	赵文超	大连工业大学生物与食品工程学院	3	52	2.0	3.0