低温碱性蛋白酶QDAPr的生物信息学分析及同源模建

• 作者: 孙谧 王跃军 袁翠 郝建华
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 碱性蛋白酶 生物信息学 同源模建
• 年，卷（期）: 2006,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 62-64
• 页数: 3页
• 分类号: Q939.1
• 字数: 2584字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2006.02.004

摘要

对一株来自黄海的假单胞杆菌QD80所产的碱性蛋白酶QDAPr进行了生物信息学分析,并用生物信息学软件对其空间结构进行了模拟,同时对模建结果进行了结构质量的分析和检测.最后对模建的结果进行了初步的实验验证.结果表明:该碱性蛋白酶的等电点为8.52,外源性氨基酸为32.9%,二级结构中α螺旋占5.88%,β折叠片占14.6%,与铜绿假单胞菌的碱性蛋白酶的同源性为76%.三维结构检测表明此模型的结构符合立体化学和生物学功能.同源性分析表明该模建模型含有HEXXHXUGUXH的基元(motif),通过BrAc修饰实验初步验证了活性中心的功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙谧	中国水产科学研究院黄海水产研究所海洋酶工程重点实验室	97	1319	19.0	32.0
2	王跃军	中国水产科学研究院黄海水产研究所海洋酶工程重点实验室	64	933	17.0	27.0
3	郝建华	中国水产科学研究院黄海水产研究所海洋酶工程重点实验室	31	185	8.0	12.0
4	袁翠	中国水产科学研究院黄海水产研究所海洋酶工程重点实验室	4	32	4.0	4.0