高粱苯丙氨酸解氨酶(SbPAL)编码蛋白的生物信息学分析

• 作者: 刘宝玲 张晓瑛 薛金爱 郝青婷
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 高粱 苯丙氨酸解氨酶 木质素 抗病性 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 1584-1588
• 页数: 5页
• 分类号: S514
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2016.11.02

摘要

高粱是世界上一种重要的粮食作物,具有耐寒耐高温等优良性质,挖掘高粱抗病基因(如PAL),在基因水平上进行遗传改良,提高高粱对贫瘠土地的耐受性仍是研究热点之一.以高粱的苯丙氨酸解氨酶基因(SbPAL)为研究对象,运用生物信息学方法对其编码蛋白的结构、理化性质及功能结构域进行分析,以期揭示苯丙解氨酶的基本信息.结果表明,高粱Sb PAL基因的编码序列(Coding sequences,CDS)全长为2 145 bp,编码714个氨基酸;高粱SbPAL蛋白主要位于细胞基质中,二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构预测其为同源四聚体结构,由4个相同亚基对称性组成,各亚基之间由配体DTT共价连接.多序列比对结果表明,高粱SbPAL蛋白与拟南芥、水稻、葡萄、烟草等蛋白的同源性较高,为83.31％,SbPAL基因与玉米、水稻和大麦有着较近的亲缘关系,PAL在这些作物中主要参与木质素和植保素的合成.此分析结果将为后续进一步研究SbPAL对木质素、植保素等合成的分子机制与抗病性关系奠定一定的理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛金爱	山西农业大学农学院	15	28	3.0	5.0
2	张晓瑛		4	13	3.0	3.0
3	刘宝玲	山西农业大学农学院	6	12	2.0	3.0
4	郝青婷	山西农业大学农学院	3	6	2.0	2.0