枣L-半乳糖-1-磷酸磷酸酶cDNA克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘孟军 卜娇迪 赵智慧 赵锦 陈莹莹
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 枣 L-半乳糖-1-磷酸磷酸酶 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 页码范围: 33-37,55
• 页数: 6页
• 分类号: Q785|S665
• 语种: 中文
• DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2014.0137

摘要

枣果是抗坏血酸含量最高的果实之一,而L-半乳糖-1-磷酸磷酸酶(L-galactose-1-phosphate phosphatase,GPP)基因是抗坏血酸合成中的一个重要基因,至今未见该基因在枣中的相关报道.本研究根据GenBank中登录的苹果、桃和拟南芥等植物GPP保守序列设计引物,采用RT-PCR法,从‘金丝小枣'(Ziziphus jujuba‘Jinsixiaozao’)叶片中克隆出该基因并对其编码的蛋白进行了生物信息学分析.该基因包含完整的开放阅读框为813 bp,编码270个氨基酸残基,预测分子量为29.083 kDa,理论pI值为5.28,命名为ZjGPP(登录号KJ739593);进一步的生物信息学分析表明,该序列具有典型的肌醇单磷酸化酶结合区域,属于FIG家族蛋白;其氨基酸与其他植物GPP基因具有较高的同源性.进化树分析表明,该基因与桃、苹果和刺梨等蔷薇科植物的GPP亲缘关系较近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵锦	河北农业大学生命学院	80	1277	21.0	32.0
2	刘孟军	河北农业大学中国枣研究中心	195	3609	34.0	49.0
3	赵智慧	河北农业大学中国枣研究中心	24	368	10.0	18.0
4	陈莹莹	河北农业大学中国枣研究中心	9	25	4.0	4.0
5	卜娇迪	河北农业大学生命学院	4	19	3.0	4.0