大豆紫色酸性磷酸酶GmPAP14克隆与生物信息学分析

• 作者: 刘渊 孔佑宾 宁英达 常文锁 张彩英 李喜焕
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 低磷胁迫 大豆 紫色酸性磷酸酶(PAP)基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 页码范围: 7-11,24
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文

摘要

采用RT-PCR技术克隆大豆紫色酸性磷酸酶(Purple acid phosphatase,PAP)基因,并对基因及其编码蛋白进行生物信息学分析,为植物磷高效转基因育种及分子机制解析提供候选基因.结果表明:从低磷处理14 d的‘中黄15' cDNA中克隆获得-条开放阅读框1 395 bp的基因,经保守域分析发现该基因属于紫色酸性磷酸酶类,命名为GmPAP14(GenBank No.JN967626).对基因编码蛋白进行生物信息学分析发现,GmPAP14编码1条含有464个氨基酸残基的多肽链,分子量约53.1 kD,理论等电点6.14,且含有紫色酸性磷酸酶所特有的5个保守基序和7个金属离子结合位点.进-步分析发现GmPAP14具有跨膜结构与信号肽,定位于质膜或分泌到胞外.经系统发育树分析显示GmPAP14与苜蓿MtPAP1及大豆GmPAP1具有同源性,预测可能与植物磷素高效吸收利用有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孔佑宾		1	14	1.0	1.0
2	刘渊		1	14	1.0	1.0
3	李喜焕		1	14	1.0	1.0
4	常文锁		1	14	1.0	1.0
5	张彩英		1	14	1.0	1.0