禾谷镰刀菌cAMP受体类GPCR生物信息学分析

• 作者: 张旭 马聿迪
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 农学
• 关键词: G蛋白偶联受体 信号转导 禾谷镰刀菌 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 97-104
• 页数: 8页
• 分类号: S512.1
• 字数: 4375字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.20160801001

摘要

禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum)是引起小麦赤霉病的主要致病菌.G蛋白偶联受体(G protein coupled receptors,GPCRs)是一类重要的细胞表面受体,其介导的cAMP信号通路可能参与了禾谷镰刀茵的致病和毒素合成,因此分析cAMP受体类型的GPCRs蛋白的结构及其理化性质对了解GPCRs的功能及其与赤霉病致病的关系具有重要意义.本研究运用生物信息学方法,对禾谷镰刀菌全基因组序列中cAMP类GPCR基因进行了生物信息学分析.发现禾谷镰刀菌中存在5个典型的cAMP受体类型GPCRs:FgcAR1、FgcAR2、FgcAR3、FgcAR4和FgcAR5,均含有7个跨膜结构域,并定位于细胞膜上.除Fg-cAR1外,其余为疏水性蛋白.蛋白质二级结构分析表明,均含有大量o螺旋,比例在60％左右,FgcAR4和FgcAR5没有β转角,FgcAR1、FgcAR2和FgcAR3也只有较少比例的β转角.这些GPCRs中含有较多的Ser和Thr磷酸化位点.遗传分析表明,禾谷镰刀菌cAMP受体类型的GPCR蛋白与假禾谷镰刀菌及F.langsethiae同源性最高,亲缘关系最近.本研究明确了禾谷镰刀菌中cAMP类GPCR蛋白的理化性质、定位、二级结构、磷酸化位点及进化关系,为了解小麦赤霉病发病机制及以GPCRs为靶标的新型杀菌剂研发奠定了基础.