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大鲵致病性嗜水气单胞菌主要毒力基因的生物信息学分析
大鲵致病性嗜水气单胞菌主要毒力基因的生物信息学分析
作者:
丁诗华
凌空
原文服务方:
中国兽医杂志
大鲵
嗜水气单胞菌
毒力基因
生物信息学
摘要:
根据嗜水气单胞菌的溶血素(HlyA)、外膜蛋白(Omps)及丝氨酸蛋白酶(AhpA)基因,分别设计3对特异性引物.通过3重PCR法对三对基因进行克隆与生物信息学分析.溶血素、外膜蛋白及丝氨酸蛋白酶基因的开放阅读框分别为1 863 bp、1 071 bp及894 bp,分别编码621、357及298个氨基酸.同时,对其氨基酸序列进行系统进化树构建、蛋白理化性质分析、蛋白信号区域和结构区域分析、蛋白二级结构预测、蛋白三级结构预测及蛋白免疫原性分析.本研究对大鲵源致病性嗜水气单胞菌主要毒力基因进行生物信息学分析,为进一步研究嗜水气单胞菌保护性抗原多样性而提供理论基础.
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文献信息
篇名
大鲵致病性嗜水气单胞菌主要毒力基因的生物信息学分析
来源期刊
中国兽医杂志
学科
关键词
大鲵
嗜水气单胞菌
毒力基因
生物信息学
年,卷(期)
2015,(5)
所属期刊栏目
鱼虾疾病
研究方向
页码范围
83-86,后插9
页数
5页
分类号
S941.42
字数
语种
中文
DOI
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丁诗华
西南大学动物科技学院
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凌空
西南大学动物科技学院
4
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大鲵
嗜水气单胞菌
毒力基因
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中国兽医杂志
主办单位:
中国畜牧兽医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0529-6005
CN:
11-2471/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1953-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
12894
总下载数(次)
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54031
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