希金斯炭疽菌GPCR蛋白生物信息学分析

• 作者: 韩长志
• 来源期刊: 华中师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 希金斯炭疽菌 G蛋白偶联受体 信号肽 二级结构 炭疽菌属
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 页码范围: 246-251
• 页数: 6页
• 分类号: S435.1
• 字数: 2739字
• 语种: 中文

摘要

希金斯炭疽菌可以侵染诸多十字花科植物引起炭疽病,给各国农业生产造成了巨大经济损失.GPCR作为生物体内G蛋白信号转导途径中的重要感知蛋白,在信号传递过程中发挥着重要作用.本研究基于酿酒酵母中已经报道的3个典型GPCR序列,利用Blastp以及关键词对炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,以及通过TMHMM、HMMTOP跨膜结构域分析,明确该菌存在4个典型的GPCR;同时,通过对上述氨基酸序列进行细胞信号肽、亚细胞定位以及二级结构等生物信息学分析,明确上述GPCR均具有较高比例的α螺旋结构以及均不含有明显的信号肽序列;在定位方面,4个GPCR均定位在质膜上.此外,通过对希金斯炭疽菌中的4个GPCR与其他物种中的23个同源序列进行遗传关系比较分析,发现该菌中的GPCR与C.graminicola、C.fioriniae等炭疽菌属中的病菌具有较高的同源序列以及较近的亲缘关系.该研究为深入开展希金斯炭疽菌GPCR功能研究打下坚实的理论基础,同时,也为进一步开展其他炭疽菌的研究提供重要的理论指导.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩长志	西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室	74	325	9.0	16.0