草莓胶孢炭疽菌GPCRs超家族蛋白鉴定及生物信息学分析

• 作者: 张丽勍 段可 邹小花 高清华
• 来源期刊: 上海农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 草莓 胶孢炭疽菌 G蛋白偶联受体 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子遗传学
• 页码范围: 1-9
• 页数: 9页
• 分类号: S668.4|Q78
• 字数: 6223字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15955/j.issn1000-3924.2017.01.01

摘要

G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptors,GPCRs)是广泛存在于生物体中的一类膜受体家族.基于粗糙脉孢菌典型GPCR蛋白氨基酸序列及其典型结构域对胶孢炭疽菌全基因组数据库进行比对分析,获得GPCRs超家族蛋白;对GPCRs超家族蛋白进行生物信息学分析.结果表明:胶孢炭疽菌中存在8个GPCR蛋白,其中碳源感应因子类有3个;类cAMP受体类有2个,信息素受体、氮源感应因子和真菌视蛋白类各1个.所有的GPCR都具有典型的7个跨膜结构域及较高比例的α-螺旋和无规则卷曲,且均不含信号肽序列.通过遗传关系比较分析发现,胶孢炭疽菌的8个GPCR蛋白聚类在一起,构成2个主要进化大分支和5个小分支,该聚类与其基于保守结构域的归属类别一致.本研究为进一步探究草莓胶孢炭疽菌GPCRs超家族成员的功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高清华	上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室	40	256	9.0	15.0
2	段可	上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室	20	33	3.0	5.0
3	张丽勍	上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室	12	13	3.0	3.0
4	邹小花	上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室	6	5	1.0	2.0