基于打分矩阵的多类蛋白质折叠子的预测

• 作者: 张晓东 王春连
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 打分矩阵 相似性打分函数 蛋白质折叠子 氨基酸的保守指数
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 42-45,49
• 分类号: Q518.2
• 字数: 3499字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2011.01.011

摘要

依据蛋白质折叠子中氨基酸保守性,以氨基酸、氨基酸的极性、氨基酸的电性以及氨基酸的亲-疏水性为参数,从蛋白质的氨基酸序列出发,采用"一对多"的分类策略,通过构建打分矩阵和选取氨基酸序列模式片断,利用5种相似性打分函数对27类折叠子进行识别,最好的预测精度达到83.46%.结果表明,打分矩阵是预测多类蛋白质折叠子有效的方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王春连		4	0	0.0	0.0
2	张晓东		1	0	0.0	0.0