基于多特征融合的蛋白质折叠子预测

• 作者: 姜涛 张绍武 施建宇 潘泉 邵壮超
• 来源期刊: 北京生物医学工程
• 学科: 医学
• 关键词: 折叠子预测 多特征融合 支持向量机 多类分类
• 年，卷（期）: 2006,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 482-485,519
• 页数: 5页
• 分类号: R318.04|TP391
• 字数: 2688字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-3208.2006.05.009

摘要

蛋白质折叠子预测为启发式搜索蛋白质三级结构提供了有用的信息.目前已知的折叠子预测方法大多数基于单种特征或多种特征的简单组合,本文采用一种多特征融合方法,从蛋白质的一级序列出发,对27类折叠子进行预测.使用支持向量机作为分类器,采用多对多的多类分类策略,以氨基酸组成成分、极性、极化性、范德瓦尔斯量、疏水性和预测的二级结构作为样本的六种特征,进行多特征融合,独立样本预测总精度为59.22%,与Ding等人的结果比较提高了3.2%,结果表明多特征融合方法是一种有效的蛋白质折叠子预测方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘泉	西北工业大学自动化学院	544	9437	45.0	77.0
2	姜涛	西北工业大学自动化学院	11	53	5.0	7.0
3	张绍武	西北工业大学自动化学院	66	809	14.0	26.0
7	施建宇	西北工业大学自动化学院	19	166	6.0	12.0
8	邵壮超	西北工业大学自动化学院	3	8	2.0	2.0