Hsa-miR-210-5p靶基因预测及其相关信号通路的生物信息学分析

• 作者: 蔡丹平 龙鼎新
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: miR-210-5p 靶基因 信号通路 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 109-115
• 页数: 7页
• 分类号: Q343.1
• 字数: 3443字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12113/201907003

摘要

为深入研究miR-210-5p的调控机制及生物学功能提供理论机制,应用生物信息学方法分析miR-210-5p序列,预测其靶基因,用Veney2.1.0绘制韦恩图得到靶基因集合,并对其靶基因集合进行蛋白质互作分析,GO功能注释分析和KEGG Path-way分析.结果发现,已知的成熟miR-210-5p序列在各物种间高度保守.蛋白质互作分析显示,miR-210-5p预测靶基因所编码蛋白质间相互作用关系较复杂,尤其是靶基因CDK8、MED18、MED13等编码的蛋白质,在互作中起关键作用.GO分析发现其靶基因集合可能参与细胞组分、分子功能、生物调节等生物学过程;KEGG pathway分析发现其靶基因集合主要富集在MAPK、VEGF、癌症、甲状腺激素信号通路等信号通路.miR-210-5p调控靶基因参与多种重要的生物学过程,为后续研究提供了线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	龙鼎新	南华大学船山学院	76	328	11.0	15.0
2	蔡丹平	南华大学船山学院	1	0	0.0	0.0