rno-miR-16-5p靶基因预测、生物信息学分析及鉴定

• 作者: 冯知涛 梅志刚 潘茂兴 王芳 蔡三金
• 来源期刊: 实用医学杂志
• 关键词: rno-miR-16-5p 靶基因 生物信息学 脑源性神经营养因子 信号通路
• 年，卷（期）: 2019,（14）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 2215-2219
• 页数: 5页
• 字数: 3660字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-5725.2019.14.005

摘要

目的 对rno-miR-16-5p靶基因进行预测、生物信息学分析及鉴定,为深入研究rno-miR-16-5p的生物学功能奠定基础.方法 应用TargetScan、miRDB、miRanda数据库预测出rno-miR-16-5p的靶基因,对靶基因进行基因本体论(GO)注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)生物通路富集分析,并利用双荧光素酶报告实验鉴定.结果 3个数据库预测出的交集靶基因有48个,rno-miR-16-5p靶基因主要富集于细胞生长发育、促进突触合成及神经系统发育等生物过程,富集于血小板α颗粒、细胞质动力蛋白复合体等细胞组件与粘多糖分子功能中.信号通路则显著富集于唾液分泌通路、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路与胰腺分泌通路.双荧光素酶报告实验结果提示脑源性神经营养因子(BDNF)是rno-miR-16-5p的靶基因.结论 rno-miR-16-5p靶向作用于BDNF的表达,可能通过参与cAMP信号通路促进神经系统发育的生物学过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梅志刚	三峡大学医学院国家中医药管理局中药药理科研三级实验室	52	334	12.0	16.0
2	王芳	三峡大学医学院国家中医药管理局中药药理科研三级实验室	36	136	5.0	11.0
3	蔡三金	三峡大学医学院国家中医药管理局中药药理科研三级实验室	30	155	8.0	11.0
4	潘茂兴	三峡大学医学院国家中医药管理局中药药理科研三级实验室	3	1	1.0	1.0
6	冯知涛	三峡大学医学院国家中医药管理局中药药理科研三级实验室	16	7	2.0	2.0