miRNA-126*靶基因预测及其相关信号通路的生物信息学分析

• 作者: 周晓光 周晓玉 张晓群 张盼 杨洋 阚清
• 来源期刊: 中国当代儿科杂志
• 关键词: miRNA-126* 生物信息学 肺发育 大鼠
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 论著·实验研究
• 页码范围: 227-232
• 语种: 中文
• DOI: 10.7499/j.issn.1008-8830.2013.03.015

摘要

目的 通过对miRNA-126*进行靶基因预测及信号通路生物信息学分析,以期为miRNA-126*靶基因相关实验及其调控肺发育机制的深入研究奠定基础.方法 首先利用microRNA (miRNA)芯片技术分别检测胎龄16 d、19 d和21 d胎鼠肺组织中miRNA-126*的表达水平,进而应用miRGen2.0数据库通过生物信息学方法预测其可能的靶基因,然后对其靶基因集合应用Cytoscape及其插件BiNGO进行功能富集分析(GO-analysis),最后应用DAVID数据库进行靶基因信号转导通路富集分析(KEGG Pathway analysis).结果 miRNA-126*表达量在胎龄16 d、19 d和21 d3组胎肺组织间逐渐上升.miRNA-126*预测靶基因共有422个,其靶基因集合功能富集于葡萄糖醛酸转移酶、糖代谢等分子功能,多细胞器官发育、发育进程等生物学过程及细胞分隔、细胞器界膜等细胞组分上.信号转导通路则显著富集于RNA降解信号通路,以及朊蛋白疾病信号通路中.结论 本研究结果提示miRNA-126*参与了大鼠胎肺发育过程,为今后研究肺发育提供理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周晓玉	南京医科大学附属南京儿童医院新生儿科	100	606	14.0	20.0
2	阚清	南京医科大学附属南京儿童医院新生儿科	18	103	7.0	10.0
3	杨洋	南京医科大学附属南京儿童医院新生儿科	21	69	6.0	7.0
4	张盼	南京医科大学儿科研究所	4	9	1.0	3.0
5	张晓群	南京医科大学儿科研究所	4	9	1.0	3.0
6	周晓光	南京医科大学附属南京儿童医院新生儿科	28	95	6.0	8.0