miRNA－1靶基因的生物信息学分析

• 作者: 张春芳 程远大 高阳
• 来源期刊: 医学分子生物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 生物信息学 miRNA-1 靶基因
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 193-197,202
• 页数: 6页
• 分类号: Q572
• 字数: 3130字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3870/j.issn.1672-8009.2016.04.002

摘要

目的：采用生物信息学的方法对miRNA－1的靶基因进行预测，并对其集合进行富集分析和生物学描述。方法分别采取TargetScan和PicTar对miRNA－1靶基因进行预测，取它们预测结果的合集。采用Cytospace的插件BiNGO和DAVID数据库，获得基因集合的基因本体注释和生物学通路信息并进行富集分析。结果获得miRNA－1预测的靶基因229个；分子功能富集在生物分子结合、酶调节和催化活动等；生物学过程富集在生物组装、代谢调控、应对刺激、生物合成和代谢等。生物学通路富集在富集于剪接体、囊泡运输中SNARE相互作用和小细胞肺癌。结论在高通量系统验证方法尚未建立的阶段，采用了生物信息学的方法，可以从miRNA－1调控网络中提出了进一步研究的线索。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高阳	中南大学湘雅医院胸外科	267	2542	26.0	35.0
2	程远大	中南大学湘雅医院胸外科	27	123	7.0	10.0
3	张春芳	中南大学湘雅医院胸外科	64	302	10.0	13.0