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应用高通量测序技术分析大菱鲆幼鱼肠道及其养殖环境的微生物群落结构
应用高通量测序技术分析大菱鲆幼鱼肠道及其养殖环境的微生物群落结构
作者:
吕丁
吴欢欢
孔杰
王伟继
胡玉龙
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
生物多样性
高通量测序
大菱鲆
摘要:
采用基于Illumina测序平台的高通量测序技术,对大菱鲆(Scophthalmus maximus)幼鱼肠道及其养殖水体、生物饵料中细菌种类及丰度进行研究.测序结果显示,养殖水体、生物饵料和大菱鲆幼鱼肠道等19个样品共获得有效序列547621条,可聚类于3771个可分类操作单元(OTUs),归属于养殖水体、生物饵料、健康幼鱼和发病幼鱼的操作分类单元(OTU)个数分别为3038、1090、87和777,其中,健康幼鱼与生物饵料、健康幼鱼与养殖水体特有的OTU个数分别为57和0,发病幼鱼与生物饵料、发病幼鱼与养殖水体特有的OTU个数分别为481和31.表明幼鱼肠道微生物多样性与生物饵料密切相关.根据细菌注释结果,拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)在大菱鲆幼鱼肠道中占优势地位,其中,健康幼鱼肠道微生物共聚类为8个门,发病幼鱼的肠道微生物可聚类为19个门.与健康幼鱼相比,发病幼鱼肠道门水平上的3种主要优势菌群落结构出现失衡.此外,对各样品中丰度最高的100位OTU分析显示,幼鱼肠道优势菌种类与生物饵料中的优势菌种类密切相关,而每个发病幼鱼肠道优势菌种类具有一定的独立性.本研究旨在为大菱鲆健康养殖和微生态调控提供实验依据.
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篇名
应用高通量测序技术分析大菱鲆幼鱼肠道及其养殖环境的微生物群落结构
来源期刊
渔业科学进展
学科
农学
关键词
生物多样性
高通量测序
大菱鲆
年,卷(期)
2019,(4)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
84-94
页数
11页
分类号
S968
字数
7924字
语种
中文
DOI
10.19663/j.issn2095-9869.20180507003
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渔业科学进展
主办单位:
中国水产学会
中国水产科学研究院黄海水产研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7075
CN:
37-1466/S
开本:
大16开
出版地:
山东省青岛市南京路106号(黄海水产研究所)
邮发代号:
24-153
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
2367
总下载数(次)
4
总被引数(次)
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