蝎蝽次目线粒体基因组 22 个 tRN A 基因的比较研究(半翅目:异翅亚目)

• 作者: 张丹丽 张苗苗 张虎芳 李悦锐 田菁
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 蝎蝽次目 线粒体基因组 tRNA 比较研究 系统发育
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 3818-3825
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13842／j.cnki.issn1671‐8151.201808009

摘要

[目的]本研究旨在对蝎蝽次目11科线粒体基因组中22个 tRNA基因的序列特征、遗传距离、同源基因相同核苷酸百分比和二级结构进行比较研究,同时基于22个tRNA序列构建蝎蝽次目的系统发育树. [方法]通过Gen‐Bank获得蝎蝽次目所有12个代表种的tRNA序列,在M EGA 6.0中计算tRNA基因序列特征和遗传距离,同源基因相同核苷酸百分比在BioEdit 7.1中进行,tRNA二级结构在 RNA structure 5.8中构建.在 RAxM L 8.2.8和M r‐bayes 3.2.5中构建系统发育树. [结果]结果显示蝎蝽次目11科核苷酸碱基组成(A+ T )% 平均含量为76.41%,碱基A和T的含量均高于G和C ,其中多数种呈现A高于T ,所有种呈现G高于C .蝎蝽次目11科间的遗传距离在0.13～0.26之间.核苷酸保守性较高的tRNA‐L2 、tRNA‐T和tRNA‐M 基因均位于线粒体基因组的J链,核苷酸保守性较低的tRNA‐V和tRNA‐F基因均位于线粒体基因组的N链.蝎蝽次目11科内tRNA二级结构中氨基酸接受茎表现为较高的保守性,而环中除了反密码子环相对保守外,其余环都有不同程度的碱基变异.系统发育结果显示固蝽总科、仰泳蝽总科和划蝽总科均为单系,其中固蝽总科和仰泳蝽总科为姐妹群关系,其余总科的单系性没有得到很好的解析,可能与tRNA基因序列能够提供的有效系统发育信号较少有关. [结论]本研究补充了tRNA在蝎蝽次目研究中的不足,揭示了tRNA基因及其二级结构在比较线粒体基因组学研究中的重要性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张丹丽	太原师范学院生物系	2	0	0.0	0.0
2	张苗苗	太原师范学院生物系	2	0	0.0	0.0
3	田菁	太原师范学院生物系	2	0	0.0	0.0
4	李悦锐	太原师范学院生物系	2	0	0.0	0.0
5	张虎芳	忻州师范学院生物系	5	0	0.0	0.0