一起急性胃肠炎疫情中重组诺如病毒基因特征分析

• 作者: 刘毅 李璇 石浩宇 范鹏程
• 来源期刊: 现代预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 诺如病毒 急性胃肠炎 基因型 重组
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 疾病预防控制
• 页码范围: 2251-2254
• 页数: 4页
• 分类号: R183
• 语种: 中文

摘要

目的 明确成都市2018年5月某建筑工地发生的一起急性胃肠炎疫情中的诺如病毒的基因型别,并对其遗传进化和分子流行病学特征进行分析研究.方法 对实时荧光定量PCR检测结果为阳性的标本采用常规RT-PCR扩增其RNA依赖的RNA聚合酶区和衣壳蛋白区并测序,与国内外参考株进行序列比对和构建进化树等基因特征分析.结果 序列比对和进化树分析结果显示:此次疫情中检出的诺如病毒核苷酸同源性为100％;其RNA依赖的RNA聚合酶区与北京株处于同一分支,同源性95.4％;而衣壳蛋白区与莫斯科株同源性最高,为96.4％.结合SimPlot对其进行分析,重组可能位点在213 bp处,定位在ORF1/2交叠区.结论 引起本次急性胃肠炎疫情的重组诺如病毒基因型为GI.P4-GI.5,这是成都市首次检出诺如病毒GI群重组株.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘毅	成都市成华区疾病预防控制中心检验科	9	44	3.0	6.0
2	石浩宇	成都市成华区疾病预防控制中心检验科	4	18	3.0	4.0
3	范鹏程	成都市成华区疾病预防控制中心检验科	4	13	3.0	3.0
4	李璇	成都市成华区疾病预防控制中心检验科	1	0	0.0	0.0