基于调控网络构建的食管鳞状细胞癌放疗抵抗核心miRNA/mRNA鉴定

• 作者: 王中卫 王亚利 白明华 郭亚 马红兵 黄珊
• 来源期刊: 山西医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 食管鳞状细胞癌 放疗抵抗 microRNA调控网络 TCGA 核心mRNA
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 肿瘤研究
• 页码范围: 1492-1498
• 页数: 7页
• 分类号: R735.1
• 字数: 4606字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13753/j.issn.1007-6611.2019.11.002

摘要

目的 基于食管鳞状细胞癌肿瘤组织RNA表达情况构建放疗抵抗miRNA-mRNA网络,鉴定并验证放疗抵抗核心miRNA及mRNA. 方法 癌症基因图谱(TCGA)数据库选取行放疗的食管鳞状细胞癌患者,R语言edgeR包对比获得放疗抵抗组肿瘤组织差异表达mRNA(DE mRNA)和miRNA(DE miRNA).miRWalk 3.0预测DE miRNA的靶mRNA,Cytoscape绘制放疗抵抗miRNA-mRNA调控网络.采用MMC法分析获得核心miRNA及mRNA,实时定量PCR在放射抵抗癌细胞中进行验证. 结果 共获得548个DE mRNA和5个DE miRNA,成功构建放疗抵抗miRNA-mRNA调控网络,分析后最终获得4个核心miRNA(miR-1293、miR-873、miR-375及miR-1468)和5个核心mRNA(ZDHHC22、IGFBP5、ADAM23、NTNG1和DCC).细胞学验证显示miR-1293、miR-375、IGFBP5、ADAM23在食管鳞状细胞癌放疗抵抗细胞表达具有明显差异(P＜0.05). 结论 该研究通过miRNA-mRNA调控网络构建,鉴定食管鳞状细胞癌放疗抵抗核心miRNA和mRNA,为逆转放疗抵抗提供潜在靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马红兵	西安交通大学第二附属医院肿瘤放疗科	42	166	8.0	10.0
2	王中卫	西安交通大学第二附属医院肿瘤放疗科	36	184	8.0	11.0
3	白明华	西安交通大学第二附属医院肿瘤放疗科	18	68	5.0	7.0
4	王亚利	西安交通大学第二附属医院肿瘤放疗科	34	287	10.0	15.0
5	黄珊	西安交通大学第二附属医院肿瘤放疗科	16	69	5.0	8.0
6	郭亚	西安交通大学第二附属医院肿瘤放疗科	4	8	2.0	2.0