灵芝尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因 的电子克隆与生物信息学分析

• 作者: 张贱根 李延升 杨普香 石旭平 蔡海兰 蔡翔 贺望兴 黎小萍
• 来源期刊: 江西农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 灵芝 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶 电子克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 86-94
• 页数: 9页
• 分类号: S567.3+1
• 字数: 3333字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19386/j.cnki.jxnyxb.2019.09.15

摘要

尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UGPase)是灵芝多糖合成途径的关键酶,用电子克隆方法得到灵芝UGPase基因,并利用生物信息学软件对UGPase基因编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、亲∕疏水性、信号肽、蛋白结构域、蛋白高级结构以及系统进化树的构建等方面进行了预测和分析.结果表明:UGPase基因全长1691 bp,包含一个1515 bp的完整开放阅读框,编码504个氨基酸;该蛋白不存在信号肽和跨膜结构域,它是定位于细胞质内的一种亲水性稳定蛋白酶;它的高级结构主要是由 α 螺旋结构和无规则卷曲结构所组成;同源比对分析显示,该酶基因编码的氨基酸序列和其他动植物的UGPase酶相比在序列组成、高级结构方面具有一定的相似性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨普香		101	506	11.0	17.0
2	黎小萍		64	426	11.0	17.0
3	李延升		23	53	5.0	6.0
4	张贱根		38	157	7.0	10.0
5	石旭平		49	158	7.0	10.0
6	贺望兴		15	13	2.0	2.0
7	蔡翔		7	12	2.0	3.0
8	蔡海兰		12	18	3.0	3.0