基于Dickeya dadantii特有标志基因检测甘薯茎腐病菌

• 作者: 吴秀芹 孙国昌 安千里 易建平 李斌 罗金燕
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 软腐病 甘薯茎腐病 狄克氏菌 保守标志蛋白 种特异基因
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 实验方法
• 页码范围: 688-698
• 页数: 11页
• 分类号: S435.311
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000298

摘要

甘薯细菌性茎腐病是由达旦提狄克氏菌(Dickeya dadantii)引起的一种检疫性病害,近年来在我国多地发生,严重威胁我国甘薯产业的发展.建立特异灵敏的检测D.dadantii的方法对于鉴定检疫病原菌、田间监测病原菌和防控病害有重要意义.本研究对Dickeya属菌株的全基因组序列进行比较基因组学分析,筛选到D.dadantii特有的标志基因,针对标志基因设计引物,其中针对编码登录号为WP_077245517未知蛋白基因的1对引物Dad1-F(5’-CATATCAACCAGACCAGC-CGTT-3’)和Dad1-R(5’-CGGCCTGCTTTTAAACAACGTATTA-3’)能只从D.dadantii扩增到167bp目的片段.由此建立了特异灵敏的常规PCR和实时荧光定量PCR检测D.dadantii的方法,为鉴定检疫甘薯茎腐病病原菌和田间监测病害提供了有效方法.