苏州市吴江地区人群Y染色体STR和SNP的遗传结构分析

• 作者: 吴泽 张义为 曾志凡 李士林 汤真 苏开元 范辰韵 陈天发
• 来源期刊: 法医学杂志
• 学科: 政治法律
• 关键词: 法医遗传学 短串联重复 单核苷酸多态性 Y染色体 遗传结构 单倍群 汉族 苏州
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 技术与应用
• 页码范围: 448-454
• 页数: 7页
• 分类号: DF795.2
• 字数: 4635字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12116/j.issn.1004-5619.2019.04.014

摘要

目的 分析苏州市吴江地区男性汉族人群Y染色体STR和SNP的基因分型,探索吴江地区人群的遗传结构,以进一步发掘具有该地区特异性的Y-SNP遗传标记祖先单倍群.方法 随机采集472名吴江地区汉族男性个体的血样,采用YfilerTM Plus PCR扩增试剂盒进行基因分型,通过直接计算法得出各基因座的等位基因频率和单倍型频率,用Y-Predictor软件推测各样本的Y-SNP单倍群,并通过扩增阻滞突变系统聚合酶链反应(amplification refractory mutation system-polymerase chain reaction,ARMS-PCR)进行实验验证.结果 472名吴江地区汉族男性群体的27个Y-STR遗传标记中,共检出453种单倍型,单倍型多样性(haplotype diversity,HD)为0.99769693,其中基因多样性(gene diversity,GD)值最高的是DYF387S1a/b(0.9531)、最低的是DYS438(0.3218).根据472个样本27个Y-STR的基因分型数据,推测并实验验证得到来自C、D、N、O和Q等单倍群下游的132种单倍群.结论 本研究基于Y染色体STR单倍型,通过Y-Predictor软件预测Y-SNP单倍群并利用ARMS-PCR进行验证,引入Y-SNP遗传标记,实现了对吴江地区3个镇区人群男性家系的精细遗传结构解析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李士林	复旦大学生命科学学院	14	71	5.0	7.0
2	吴泽	复旦大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
6	陈天发		1	0	0.0	0.0
7	曾志凡		1	0	0.0	0.0
8	张义为	复旦大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
9	汤真	复旦大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
10	苏开元	复旦大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
11	范辰韵	复旦大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0