中国对虾生物量评估的环境DNA检测技术的建立及优化

• 作者: 丁小松 单秀娟 吕丁 吴欢欢 戴芳群 李苗 王伟继
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 中国对虾 eDNA 建立 优化
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: “973”专栏——近海环境变化引起的资源效应
• 页码范围: 12-19
• 页数: 8页
• 分类号: S931
• 字数: 5187字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19663/j.issn2095-9869.20180620001

摘要

近年来,环境DNA(Environmental DNA,eDNA)技术作为一种新的水生生物调查方法发展迅速,在水生生态系统的研究领域被广泛应用到物种检测、生物多样性评价、生物量评估等方面.然而,很少有研究专门评价eDNA技术操作流程中不同的eDNA富集方法与提取方法对研究结果的影响,从而针对具体研究对象建立一套最佳的eDNA技术操作流程.此外,由于物种间生活习性的差异,不同物种释放到环境中的DNA量及DNA片段大小不同,因而,针对不同研究对象需采用不同的eDNA富集与提取方法.本研究以中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)为研究对象,采用滤膜法富集eDNA,结合血液与组织DNA提取试剂盒提取eDNA.选取直径为47 mm的玻璃纤维膜、硝酸纤维膜、聚碳酸酯膜、尼龙膜共4种材质的滤膜,每种滤膜根据其孔径大小设置0.45、0.8、1.2、5μm共4个梯度,取样水量设置500ml、1L、2L共3个梯度.结果显示,滤膜材质、滤膜孔径大小及取样水体体积均对中国对虾的定性与定量分析具有一定的影响,其中,0.45 μm的玻璃纤维滤膜过滤2L水样能够检测到的DNA拷贝数最多,并依据此建立了一套中国对虾eDNA技术的操作流程,提高了中国对虾的检出率,为后续中国对虾的分布监测及生物量评估提供了基础.