瞬时受体电位M8型离子通道选择性滤器的三维结构计算建模

• 作者: 徐丽臻 杨帆
• 来源期刊: 浙江大学学报（医学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 瞬时受体电位通道 TRPM阳离子通道 氨基酸序列 计算机模拟
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 蛋白质的结构与功能
• 页码范围: 19-24
• 页数: 6页
• 分类号: Q71
• 字数: 3146字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3785/j.issn.1008-9292.2019.02.04

摘要

目的:构建瞬时受体电位M8型(TRPM8)离子通道选择性滤器结构域的三维结构模型.方法:在Rosetta计算结构生物学工具包中,使用基于运动回路闭合算法的从头计算,对TRPM8离子通道选择性滤器结构域进行多轮计算建模.结果:经过9轮计算得到了能量最低且结构收敛的TRPM8通道选择性滤器结构域的三维结构模型,发现D918位点的侧链并不指向离子流过的孔区中心,而Q914、D920和T923位点的侧链指向孔区中心;糖基化位点N934位于孔区外侧,其侧链指向胞外水环境.结论:构建了TRPM8通道选择性滤器结构域的三维结构模型,为理解该通道的离子选择性及相关机制提供了较为可靠的结构信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨帆	浙江大学医学院生物物理系	55	118	6.0	7.0
2	徐丽臻	浙江大学医学院生物物理系	1	0	0.0	0.0