肺腺癌患者外周血环状RNA差异表达谱研究

• 作者: 徐国栋 方建晨 汪春年 穆银玉 谢服役
• 来源期刊: 中国卫生检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肺腺癌 生物信息学 环状RNA 表达谱
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 临床检验
• 页码范围: 211-214
• 页数: 4页
• 分类号: R733
• 语种: 中文

摘要

目的 筛选肺腺癌患者外周血中差异表达的环状RNA(circular RNA,circRNA),并进行生物信息学分析,以探讨外周血circRNA在肺腺癌发病中的作用.方法 采用Illumina公司Solexa高通量测序对5例肺腺癌患者和5例健康对照者的外周血中的circRNA进行筛查,用R软件包对数据进行归一化及后续数据处理,通过log2foldchange和P值进行筛选,采用t检验,寻找2组样本间差异表达的circRNA,并对差异表达的circRNA进行生物信息学分析.结果 高通量测序筛查结果提示,有4 390个circRNA在肺腺癌组和对照组之间差异有统计学意义(P＜0.05),3 009个circRNA上调,1381个circRNA下调.对这些circRNAs所涉及的基因进行基因本体论(GO)分析,结果显示,这些基因主要参与生物学调控、细胞分化、代谢过程等.对每个差异表达的circRNA的靶miRNA进行预测.结论 肺腺癌患者外周血中出现许多差异表达的circRNA,circRNA可能参与肺腺癌的调控机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方建晨		9	13	2.0	3.0
2	谢服役		28	73	5.0	7.0
3	徐国栋		11	33	4.0	5.0
4	穆银玉		11	23	3.0	4.0
5	汪春年		8	18	3.0	4.0