基于基因表达谱的途径筛选肺腺癌治疗药物

• 作者: 叶云 杨晓勤 梁爽 王桂平 郑文岭 陈新美 马文丽
• 来源期刊: 中国临床药理学与治疗学
• 关键词: 基因表达谱 肺腺癌 Connectivity map
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 页码范围: 266-272
• 分类号: R965.2
• 语种: 中文

摘要

目的:探讨基于基因表达谱的途径在肺腺癌治疗药物筛选中的应用.方法:从GEO数据库中获得GSE10072和GSE7670两个数据集,然后利用dchip软件进行差异表达基因分析,采用基因集富集方法(gene set enrichment analysis,GSEA)对肺腺癌进行通路富集分析,最后通过Connectivity map(Cmap)筛选肺腺癌候选治疗化合物,并进行实验验证.结果:共获得差异表达基因379个,其中上调基因94个,下调基因285个;GSEA主要富集到细胞周期等18条信号通路与肺腺癌相关;通过Cmap分析,筛选到Vorinostat、15-delta prostaglandin J2、trichostatin A、tanespimycin等8种候选药物或化合物,在进一步的实验中也证实15d-PGJ(2)可有效抑制A549细胞的增殖.结论:基于基因表达谱的途径为药物发现提供新思路,加速了药物发现过程.