Affymetrix基因表达谱芯片技术筛选胰腺癌异常表达基因的研究

• 作者: 丁伟 依马木买买提江·阿布拉 易超 晏冬 李海军 苏雅婷
• 来源期刊: 中国普通外科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 胰腺肿瘤 基因表达谱 芯片分析技术 基因本体 信号传导
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 294-303
• 页数: 10页
• 分类号: R735.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.3978/j.issn.1005-6947.2017.03.005

摘要

目的:利用基因表达谱芯片筛选出胰腺癌组织与癌旁正常组织的差异表达基因.方法:收集新疆医科大学第三附属医院2014年1月—2016年6月间手术切除的10例胰腺导管细胞癌组织及其相应癌旁正常组织,用TRIzol法提取总RNA后采用含49395个基因探针的Affymetrix基因表达谱芯片筛选出差异表达基因,并行GO分析和pathway分析,对部分差异表达基因行实时定量PCR法验证表达情况.结果:样本总RNA检测合格,基因芯片质量评估良好,检测结果可靠且可重复性高.经芯片降噪处理后共检测38079个基因,其中存在差异表达的基因共512个,表达上调的基因419个,表达下调的基因93个;共287个差异表达基因编码与3个GO分类(生物学过程、分子功能、细胞组分)相关的蛋白;共29条信号通路存在明显基因差异表达,涉及126个基因.经PCR验证,差异表达基因CPB1、CELA3B、CPA1、POSTN、PLA2G1B、CTRC及SPINK1的表达情况与基因芯片检测结果吻合.结论:胰腺导管细胞癌组织与癌旁正常组织间存在大量差异表达的基因,这些基因主要与生物学过程、分子功能及细胞组分相关,且参与了多个细胞信号通路的调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	丁伟	新疆医科大学第三附属医院肝胆外科	39	192	7.0	12.0
2	依马木买买提江·阿布拉	新疆医科大学第三附属医院肝胆外科	12	39	3.0	5.0
3	易超	新疆医科大学第三附属医院肝胆外科	18	74	4.0	8.0
4	苏雅婷	新疆医科大学第五附属医院医务部	7	16	2.0	3.0
5	晏冬	新疆医科大学第三附属医院肝胆外科	32	124	5.0	9.0
6	李海军	广东省深圳市罗湖区人民医院普通外科	3	45	2.0	3.0