2016～2017年中国沿海省市虾类偷死野田村病毒(CMNV)分子流行病学调查

• 作者: 万晓媛 宋增磊 张庆利 李小平 王秀华 程东远 董宣 邱亮 黄倢
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 偷死野田村病毒 分子流行病学调查 逆转录套式PCR 逆转录环介导等温扩增 TaqMan实时荧光定量RT-PCR 行动障碍野田村病毒
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 65-73
• 页数: 9页
• 分类号: S945.1
• 字数: 6416字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19663/j.issn2095-9869.20180420003

摘要

偷死野田村病毒(CMNV)引起的病毒性偷死病(VCMD)使中国对虾养殖业遭受了严重的经济损失,为查明CMNV及其变异株的分子流行病学特征,本研究采用逆转录套式PCR (RT-nPCR)、逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)和TaqMan实时荧光定量PCR(TaqMan RT-qPCR)3种方法,对2016～2017年中国沿海省市CMNV及一种新型野田村病毒——行动障碍野田村病毒(MDNV)的流行、分布和变异情况进行了分析.结果 显示,养殖凡纳滨对虾、中国明对虾、日本囊对虾、斑节对虾和罗氏沼虾等种类中均可检测到CMNV阳性;在河北、山东、浙江、福建、广东和海南等省市采集的患病对虾中均存在CMNV.基于RT-nPCR、RT-LAMP和TaqMan RT-qPCR的检测结果显示,2016和2017年样品中CMNV的阳性检出率依次分别为11.8％和7.8％,6.7％和3.9％,17.7％和12.4％;基于上述3种方法检测结果计算得出,2016和2017年样品中CMNV的阳性检出率分别为26.8％和16.3％;基于RT-LAMP的分析显示,2016年样品中MDNV的阳性检出率为9.4％.本研究表明,中国沿海省市养殖虾类中VCMD的流行和危害仍不容忽视,RNA依赖的RNA聚合酶基因不断变异导致前期基于该基因开发的CMNV检测方法可靠性下降,检出假阴性风险升高;同时,发病对虾中出现了新的野田村病毒株系且具有较高的流行率,其传播危害风险值得高度关注.