舌苔细菌PCR-DGGE分析条件的建立与优化

• 作者: 刘罡 夏永军 方玲 熊智强 艾连中
• 来源期刊: 中国微生态学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: PCR-DGGE 舌苔细菌 16S rDNA 条件优化
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 口腔微生态学
• 页码范围: 793-799
• 页数: 7页
• 分类号: R34
• 语种: 中文
• DOI: 10.13381/j.cnki.cjm.201907010

摘要

目的 针对口腔舌苔细菌16S rDNA序列进行变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)适用序列的筛选及电泳条件的优化.方法 以DGGE图谱的高分辨率为指标,选择舌苔细菌DGGE分离最适的16S rDNA高变区、电泳电压和电泳时间,并采用优化的条件分析健康青年人舌苔细菌群落的分布.结果 舌苔细菌16S rDNA V3高变区引物序列能获得更加丰富清晰的DGGE条带;基于该区,当变性剂浓度为30％～60％、电泳温度60℃、电压60 V和电泳时间14 h时能得到分辨率最佳的DGGE图谱.运用此优化条件对12个样本舌苔细菌群落的分析表明,舌苔微生物主要由厚壁菌门、梭杆菌门、拟杆菌门和变形菌门等组成.优化后的DGGE技术对舌苔细菌多样性的分析具有准确性、灵敏性和可重复性.结论 DGGE图谱显示,不同分析条件对图谱类型和细菌多样性指数均有所差异.利用优化的DGGE条件能有效分离舌苔细菌16S rDNA V3区序列,为口腔微生物群落结构分析提供可靠的技术支持,也为其他不同生态细菌的多样性分析提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘罡	复旦大学附属华山医院康复医学科	15	72	2.0	8.0
2	夏永军	上海理工大学医疗器械与食品学院上海食品微生物工程研究中心	47	101	6.0	8.0
3	艾连中	上海理工大学医疗器械与食品学院上海食品微生物工程研究中心	64	124	7.0	8.0
4	方玲	上海理工大学医疗器械与食品学院上海食品微生物工程研究中心	2	0	0.0	0.0
5	熊智强	上海理工大学医疗器械与食品学院上海食品微生物工程研究中心	24	45	4.0	6.0