加权基因共表达网络探究链状亚历山大藻爆发性生长的分子机制

• 作者: Sadaf RIAZ 刘昊昕 刘源 隋正红
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 链状亚历山大藻 赤潮 WGCNA 基因共表达模块 枢纽基因
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 66-76
• 页数: 11页
• 分类号: S917.3
• 字数: 8135字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16441/j.cnki.hdxb.20180119

摘要

链状亚历山大藻(Alexandrium paci ficum)作为典型的产毒赤潮甲藻,分布广泛,而对其爆发性生长的研究将有助于探究由其引发的赤潮的分子机制.本研究通过模拟赤潮爆发的条件对链状亚历山大藻进行表达谱测序,利用表达谱测序后得到的基因表达量数据,采用加权基因共表达网络(WGCNA)构建方法探究链状亚历山大藻的爆发性生长的分子机制.通过计算基因间表达量的相关性得到了35个基因共表达模块,将基因共表达模块与链状亚历山大藻爆发性生长性状相关联,在爆发性生长阶段,有6个显著性相关的模块,基于KEGG及GO功能富集分析,这些模块涉及蛋白质的加工合成、核糖体的合成,电子传递,碳水化合物代谢等过程,表明了细胞代谢能力的提升,为细胞增殖提供了物质基础.此外有大量的未知功能的枢纽基因被发现,基因模块可以用于推测这些基因的功能,从而为以后挖掘新基因,探究潜在的调控机制提供了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	隋正红	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	46	403	10.0	18.0
2	刘昊昕	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	5	0	0.0	0.0
3	刘源	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	5	0	0.0	0.0