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摘要:
目的 检测及分析与微RNA-32(miRNA-32)基因上游启动子区域相互作用的蛋白.方法 采用DNA pulldown技术联合质谱鉴定的方法检测miRNA-32启动子区域相互作用的蛋白,并用生物信息学方法对这些蛋白进行GO富集及KEGG通路分析.结果 在大肠癌HCT-116细胞中总共鉴定到191个与miR-NA-32启动子区域特异性结合的蛋白.GO功能富集分析显示,这些蛋白涉及多种生物学功能,包括参与核酸代谢、基因转录、细胞周期、细胞生长和再生等过程.KEGG通路分析表明这些蛋白参与多条信号通路,包括间隙连接、细胞周期信号通路、MAPK信号通路等.结论 与miRNA-32启动子区域有相互作用的蛋白具有多种生物学功能及参与多条信号通路.
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文献信息
篇名 miRNA-32启动子区域相互作用蛋白的分析
来源期刊 重庆医学 学科 医学
关键词 质谱分析法 启动子 DNA pulldown GO富集 KEGG信号通路
年,卷(期) 2019,(10) 所属期刊栏目 论著·基础研究
研究方向 页码范围 1657-1660
页数 4页 分类号 R735.3+4
字数 3332字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1671-8348.2019.10.009
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作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 吴巍芸 广东医科大学附属医院消化内科 4 5 2.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
质谱分析法
启动子
DNA pulldown
GO富集
KEGG信号通路
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
重庆医学
半月刊
1671-8348
50-1097/R
大16开
重庆市渝北区宝环路420号
78-27
1972
chi
出版文献量(篇)
30732
总下载数(次)
32
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