传染性法氏囊病病毒感染DF-1细胞的转录组学分析

• 作者: 俞天奇 周继勇 张宜娜 彭曦冉 胡伯里
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 传染性法氏囊病病毒(IBDV) 高通量测序 转录组 信号通路
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1101-1109
• 页数: 9页
• 分类号: S855
• 字数: 5157字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2019.06.016

摘要

传染性法氏囊病病毒(Infectious bursal disease virus,IBDV)感染鸡(Gallus gallus)引起的IBD是一种严重的、高度传染的免疫抑制性疾病.为探索IBDV感染所引起的宿主细胞转录组变化,本研究以IBDV感染鸡成纤维细胞系DF-1,提取细胞总RNA,使用TruSeq(R) RNA LT Sample Prep Kit v2构建RNA文库,采用Illumina HiSeq 3000平台进行高通量测序,分析IBDV感染12h引起的DF-1细胞转录组变化,筛选显著变化基因.实验结果显示,差异表达基因总共有3 417条,其中在IBDV感染组中相对高表达的基因有1 887条,相对低表达的基因有1 530条(差异倍数(Fold change,FC)＞2且P≤0.05).对差异基因进行基因本体(Gene Ontology,GO)注释及KEGG信号通路富集分析,发现IBDV感染能够引起DF-1细胞中免疫、凋亡、代谢等20多条信号通路发生显著变化;其中细胞免疫和细胞凋亡通路可能在IBDV感染和免疫调控机制中具有重要作用.随机选择9条差异表达基因进行qRT-PCR验证,变化趋势与转录组数据一致.本研究为揭示IBDV致病及免疫抑制的分子机制提供了参考信息.