基于高通量测序的褐飞虱肠道微生物多样性分析

• 作者: 俞晓平 朱杭锋 王天召 王正亮 王紫晔
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 褐飞虱 肠道微生物 16S rRNA ITS2 高通量测序 细菌 真菌 物种多样性
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 病理与微生物
• 页码范围: 323-333
• 页数: 11页
• 分类号: Q965.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2019.03.006

摘要

[目的]探明褐飞虱Nilaparvata lugens成虫肠道微生物群落结构和多样性.[方法]分离褐飞虱成虫完整肠道并提取总DNA,利用Illumina MiSeq(PE300)技术对其肠道细菌16S rRNA的V3-V4变异区和真菌ITS2序列进行测序,统计肠道微生物的操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)数量,分析其物种组成、丰度及Alpha多样性.并通过qPCR技术验证随机挑选注释到的4种肠道菌的高通量测序数据的有效性.[结果]分别获得褐飞虱成虫肠道细菌16S rRNA和真菌ITS2优质序列32 395和24 986条,根据序列相似性进行聚类分析分别获得235和128个OTUs.其中,细菌共注释到7个门,15个纲,26个目,45个科和73个属;真菌共鉴定到3个门,9个纲,12个目,15个科和18个属.在门分类水平上,细菌以变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)为优势门类;真菌以子囊菌门(Ascomycota)为绝对优势菌门.在属分类水平上,细菌的优势属为不动杆菌属Acinetobacter以及紫单胞菌科(Porphyromonadaceae)未确定属和毛螺菌科(Lachnospiraceae)未确定属,其丰度分别为36.37％,17.22％和15.01％;真菌的优势属为粪壳菌纲(Sordariomycetes)未确定属,丰度为95.77％.Alpha多样性分析结果显示,褐飞虱肠道细菌(真菌)的观测物种数、Chaol指数、Shannon指数和Simpson指数分别为235(128),262.64(165.40),3.90(0.91)和0.62(0.75).4种肠道菌的qPCR结果显示高通量测序数据具有较高的有效性.[结论]褐飞虱成虫肠道细菌和真菌群落整体多样性比较丰富.研究结果为从共生微生物角度解析褐飞虱的环境适应性以及开发基于微生物防治的新技术等方面提供了依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	俞晓平	中国计量大学生命科学学院浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室	101	640	14.0	19.0
2	王正亮	中国计量大学生命科学学院浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室	5	25	4.0	5.0
3	朱杭锋	中国计量大学生命科学学院浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室	2	4	1.0	2.0
4	王天召	中国计量大学生命科学学院浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室	2	11	2.0	2.0
5	王紫晔	中国计量大学生命科学学院浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室	1	4	1.0	1.0