生物信息学方法分析CYP2U1在膀胱癌中的临床意义

• 作者: 张冲 张宗泽
• 来源期刊: 武汉大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 膀胱癌 生物信息学 CYP2U1 差异基因 预后 诊疗靶点
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 肿瘤学研究
• 页码范围: 762-768
• 页数: 7页
• 分类号: R737.11
• 语种: 中文
• DOI: 10.14188/j.1671-8852.2018.0464

摘要

目的:运用生物信息学方法探索CYP2U1基因在膀胱癌中的表达差异情况及与预后的相关性.方法:从GEO网站下载基因芯片GSE7476、GSE13507、GSE40355的数据集,用R软件筛选膀胱癌和正常膀胱组织之间的差异表达基因,以及与预后(总生存和肿瘤特异性生存)相关的基因.然后将公共上调基因与不良预后基因取交集,公共下调基因与良好预后基因取交集,筛选出目标分子,并后续进行表达差异验证,临床指标相关性分析,以及功能预测.结果:一共筛选出上调且与不良预后相关的基因45个,下调且与良好预后相关的基因1个,并将下调基因CYP2U1作为目标分子.CYP2U1在各个数据集及数据库中呈低表达,且与良好预后、肿瘤N分期相关.GSEA结果显示其相关信号通路为KRAS信号通路、凋亡、上皮间质转化、Hedgehog信号通路和IL-2/STAT5信号通路.结论:CYP2U1可能在膀胱癌的发病过程中发挥重要的作用,可能在将来被用作潜在的人类膀胱癌的治疗靶点和/或诊断标志物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张宗泽	武汉大学中南医院麻醉手术科	164	607	12.0	17.0
2	张冲	武汉大学中南医院麻醉手术科	5	10	2.0	3.0