miRNA-148a 在膀胱癌组织中的表达及生物信息学分析

• 作者: 朱娜 潘晶晶 谢小娟 陈葳 魏力强
• 来源期刊: 现代检验医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 膀胱癌 miRNA-148a 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 论 著
• 页码范围: 6-9,13
• 页数: 5页
• 分类号: R737.14|R730.43
• 字数: 3123字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7414.2015.04.002

摘要

目的：探索 miRNA-148a 在膀胱癌发生发展中的作用。方法收集35例膀胱癌组织和16例非癌组织，采用荧光定量 PCR 方法检测 miRNA-148a 的相对表达量，并分析其与临床特征的相关性；采用生物信息学分析，预测 miRNA-148a的靶基因和转录因子，构建 TF-miRNA-148a-靶基因调控网络图，并对其靶基因进行 GO 富集和 KEGG Pathway 分析。结果miRNA-148a 在膀胱癌中的相对表达量（0.0008±0.0002）明显低于非癌组织（0.0021±0.0005）（t＝2.46，P ＜0.05），其相对表达量在不同性别、年龄、病理分级、临床分期、淋巴结转移组的差异无统计学意义（P ＞0.05）。3个软件都预测到的 miRNA-148a 靶基因268个；预测到 miRNA-148a 的转录因子60个，结合评分＞80的结合位点657个；对268个靶基因进行 GO 富集分析，发现其靶基因主要涉及神经细胞分化、发育、增殖、mRNA 合成，蛋白连接等众多的生物学过程（P ＜0.001，相对于背景具有统计意义）；KEGG Pathway 分析发现268个靶基因参与 p53，恶性肿瘤、前列腺癌、PI3K-AKT 等信号通路（P ＜0.05，相对于背景具有统计意义）；根据构建的 TF-miRNA-148a-靶基因调控网络图，挖掘出可能调控 miRNA-148a 的转录因子有 SP1，ESR1，AP1，MYC，BRCA1等；可能受 miRNA-148a 调控的基因有 IGF1，P27 kip1，NCOA1，PTEN， SERPINE1等。结论miRNA-148a 在膀胱癌中表达下调，可能参与膀胱癌的发生发展，生物信息学分析为后续研究提供一定的思路。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈葳	西安交通大学医学院第一附属医院检验科	135	538	11.0	15.0
2	朱娜	陕西省人民医院科研处	11	73	6.0	8.0
3	谢小娟		5	14	3.0	3.0
7	潘晶晶	西安交通大学医学院第一附属医院检验科	4	18	3.0	4.0
8	魏力强		3	9	2.0	3.0