基于生物信息学分析SOX12在口腔鳞状细胞癌中的表达及验证

• 作者: 刘洁 杜文治 王珍珍 贾如 逯宜
• 来源期刊: 西安交通大学学报（医学版）
• 关键词: 口腔鳞癌 SOX12 数据库分析
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 64-68
• 页数: 5页
• 分类号: R739.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.7652/jdyxb202001012

摘要

目的 通过生物信息学分析转录因子SOX12在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达,进一步探讨其与OSCC临床病理特征的关系,阐明SOX12对OSCC早期诊断及预后的影响.方法 运用GEPIA数据库结合TCGA数据库分析SOX12在OSCC组织中的表达水平,并通过qRT-PCR进行体外验证;利用LinkedOmics数据库描述SOX12表达与OSCC临床病理学参数的相关性及对预后的影响;从String-DB数据库中分析SOX12在信号转导中的位置及与其关系密切的上下游基因.结果SOX12在OSCC中呈高表达,且与OSCC病理分级、T分期、N分期呈正相关;TCGA分析显示,SOX12的表达与OSCC患者术后总体生存率有关;与SOX12相互作用的蛋白有POU3F1、POU3F2、POU3F3、MYT1L、NRSN2等,主要参与神经元的分化和发育等功能.结论SOX12在OSCC中呈高表达,并与OSCC多个病理性指标相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	逯宜	西安交通大学口腔医学院陕西省颅颌面精准医学研究重点实验室	58	254	9.0	12.0
2	刘洁	西安交通大学口腔医学院陕西省颅颌面精准医学研究重点实验室	38	108	5.0	8.0
3	杜文治	西安交通大学口腔医学院陕西省颅颌面精准医学研究重点实验室	4	15	3.0	3.0
4	王珍珍	西安交通大学口腔医学院陕西省颅颌面精准医学研究重点实验室	6	36	2.0	6.0
5	贾如	西安交通大学口腔医学院陕西省颅颌面精准医学研究重点实验室	7	11	2.0	3.0