LncRNA在柑橘木虱与黄龙病病原菌互作中的差异表达分析及验证

• 作者: 曹征鸿 梅洋 肖花美 贺康 陈梦瑶 魏圣飞
• 来源期刊: 植物保护学报
• 关键词: 长链非编码RNA 柑橘木虱 黄龙病病原菌 RNA-Seq 验证
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1252-1261
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13802/j.cnki.zwbhxb.2019.2018184

摘要

为明确柑橘黄龙病的唯一自然传播媒介——柑橘木虱Diaphorina citri的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是否参与调控黄龙病病原菌Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas)的侵染及复制,采用生物信息学预测及PCR扩增方法进行lncRNA的预测、特征分析、验证及差异表达分析.结果 显示,柑橘木虱的13个转录组RNA-Seq数据中共有10 192个lncRNA基因,对应15 747条lncRNA转录本;与蛋白质编码基因相比,柑橘木虱lncRNA具有更少的外显子数量和更短的转录本长度;随机选取的10条lncRNA基因中,有7条lncRNA基因在无菌柑橘木虱广州品系或赣州品系中有表达,其中1条lncRNA基因TCONS_00034665在无菌广州品系和无菌赣州品系中存在差异表达;带菌和无菌柑橘木虱成虫中预测获得2个差异表达的lncRNA基因TCONS_00096118和TCONS_ 00234564,实时荧光定量PCR验证发现TCONS_00234564与预测结果一致,在带菌柑橘木虱成虫中高表达.表明lncRNA参与了黄龙病病原菌与寄主柑橘木虱的互作.