不同发育阶段小尾寒羊皮肤毛囊特异性miRNA的鉴定

• 作者: 何玉龙 吴月红 周学章 李勇 杨易 陶宇
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: miRNA 高通量测序 皮肤 毛囊 小尾寒羊
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 89-96
• 页数: 8页
• 分类号: S826|Q38
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2019.01.010

摘要

小尾寒羊(Ovis aries)是我国优良的肉裘兼用型绵羊品种,因其生长速度快、产羔率高而闻名.microRNA (miRNA)是参与转录后表达水平调节的重要因子,可参与调控多种动物的皮肤和毛囊的发育.为了阐明miRNAs在小尾寒羊皮肤毛囊发育过程中的调控作用,本研究利用高通量测序技术分析了成年(XWHY_1)、出生30 d (XWHY_2)、刚出生(XWHY_3)等3个时期小尾寒羊皮肤毛囊组织的miRNAs表达谱,在3个不同发育时期共鉴定出1 062个miRNAs,包括已知miRNAs 160个,新发现miRNAs 902个.对鉴定出的miRNAs进行统计分析,在XYHY_1、XYHY 2和XYHY 3中特异性表达的miRNAs数目分别为69、127和73个,而在3个时期共表达的miRNAs为666个.统计分析采用费舍尔精确检验(Fisherexact test)和卡方检验(Chi-square test),对同时满足|log2(Fold_Change,FC)|≥1且P≤0.05的差异表达miRNAs进行统计,经XWHY_1、XWHY_2、XWHY 3两两比较筛选出339个差异表达miRNAs,去重复后得到226个差异表达miRNAs;进一步进行靶基因预测,得到2 645个靶基因.对差异表达miRNAs进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路(Pathway)富集,2645个靶基因注释到181个信号通路;对差异表达miRNAs进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析,主要包括转录调控、细胞膜组成和离子结合等过程.本研究为在miRNA水平解析皮毛/绒性状形成的分子机理提供了基础资料,同时为保持小尾寒羊现有优良品质的同时通过人工调控手段提高毛/绒产量及品质提供了新的思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周学章	宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室	55	89	5.0	7.0
2	李勇	宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室	38	156	7.0	10.0
3	杨易	宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室	28	88	5.0	8.0
4	何玉龙	浙江理工大学生命科学学院	11	12	2.0	3.0
8	陶宇	浙江理工大学生命科学学院	3	0	0.0	0.0